EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:6417679-6419173 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr7:6418606-6418616GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr7:6418606-6418616GTCACGTGAC-6.02
IRF1MA0050.2chr7:6418915-6418936CTTTACTTTTTCTTTTTTTTT+6.61
LMX1BMA0703.2chr7:6419040-6419051ATTTTAATTAA+6.62
MITFMA0620.2chr7:6418602-6418620GAAGGTCACGTGACATAC+7.31
MITFMA0620.2chr7:6418602-6418620GAAGGTCACGTGACATAC-7.31
POU1F1MA0784.1chr7:6417944-6417958ATGATTTGCATATT-6.18
POU2F1MA0785.1chr7:6417946-6417958GATTTGCATATT-6.27
POU2F2MA0507.1chr7:6417944-6417957ATGATTTGCATAT+6.05
POU4F1MA0790.1chr7:6417930-6417944ATGAATAATTGATA+6.24
POU4F3MA0791.1chr7:6417930-6417946ATGAATAATTGATAAT+6.28
SOX21MA0866.1chr7:6418031-6418046AGCAATTACATTGTT+6.88
STAT3MA0144.2chr7:6418777-6418788CTTCTGGGAAG+6.14
Sox11MA0869.1chr7:6418031-6418046AGCAATTACATTGTT+6.46
Sox1MA0870.1chr7:6418031-6418046AGCAATTACATTGTT+6.45
USF1MA0093.2chr7:6418605-6418616GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr7:6418602-6418618GAAGGTCACGTGACAT+6.02
Enhancer Sequence
TTTTCATACA TGTGACATGT GGAAACTCCA AACAATGCAT GTGCTGTGAA GAGTGGTGTC 60
ACGGATCAGT TGAAAACACG CGTCACCCGC AGATTAGTAC CTTTTTTGAA CTTGTAAATT 120
TATTTTACAT TTATAACAAT CGCAGAGATA TCGCGTCCCG GGTCATTCAA ATCACGTGTA 180
TGAAAGCATT TTGTTTTGCA AGTTTCTTGT TTAAACATTA AAAGATTGAT CTCAATTCAA 240
ACCCGCTCAA CATGAATAAT TGATAATGAT TTGCATATTT TTATTAATCC TTCGAAGTGC 300
TGTATTCACA TCTGCGTTTG ATCTAGAGGA ACTCGACGCT GGTGAATGTT GTAGCAATTA 360
CATTGTTTAA CCAATGGGTG GCGACAAACA ACCATTAAAG TTATGTCACT GAATAGGTTT 420
TCAGAAATGA TCCACCTATA ATGAAACATG AAGTTTTGTG TGTGAATTGT TGAATCATTC 480
ATTGAAAATA AATATGGAAT TGTGTTATGT ATTTGTGTTT TTTGTGCTCT GTTTCTCTGT 540
GTTTTTTCCC TCTCTCTCTT TCTCTCGCTC TCGCTCTGTT CTCCCGTATC TGCTCTCATG 600
TATTCTCAGG TTCCGTTCAT TGGTCCATTC AGCTGTCAGT CATTCCTCCC CGGTTACGTC 660
ACTCTTACGT CACATCCAAT AAGCAAAGAC CACCCGTGTT AAAAGCGCGC GCCAGACCAC 720
TTGCTCTCTC TTGCTTTCTT GCTAGCATTT TTCTCTTTCG CTGTTTTGTC GCTTGTTTGT 780
ATTTACCGCG TGCGTTTAGA AATTACCCTG TCTAACTGTG TATTTTGTTG TTGCTCGTTC 840
TGTGTGCACG TTATCCGTCC GTTATTCGTA CATTGTTCTT AGTTTATCGT TGTTTACGAG 900
GCTTGGACGA AGCGGACAGG TAAGAAGGTC ACGTGACATA CATTTCGCAA CACTCAGGAC 960
TACTCTGCTG TCTAGTACAC TAGGTTAGGG GCGAGCACCA CTCCTTGTAC TTTTTGGATA 1020
GATAGATAGA GTAGATAGGA CTCGGAAGAT CTTCGTGTGT TAATTATACT GTTTTTCACA 1080
TAGTTAGTTA GCTAGATGCT TCTGGGAAGT TAGATTTAGT TTGGGTTTTG TTCTTTTCAT 1140
TTCTTTAGCG CCGCCCGCGT CCCTTCTGCC AGCTCTCTTG TTTTTCCCGT CTTTATTTGT 1200
CTTAGTGTTG TATATATTGT AAATAGTATA TTTTTGCTTT ACTTTTTCTT TTTTTTTGAT 1260
TAATTCGTTG TTATTGTTCA CTTTGGGATT GTAAATAAAA GCACATATTT TTTGGCATTA 1320
CTTTGGTTGT CTTTCCACTC ATTCACTGTT TATATAAATA TATTTTAATT AAATAAATGT 1380
CAAACCCCAC ACCCTAGACT AACATCAGGG GTTTGTAACA AATTGTAACG AAGGGGCTGA 1440
CACAGAGGGA TCCATTTGCA GTATGTTTAT TAAACACGGT TTAATAATAA CAAG 1494