EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13504 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:5449026-5450164 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MecomMA0029.1chr7:5449255-5449269TAGATAAGATAAAG+6.25
PBX1MA0070.1chr7:5449170-5449182TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr7:5449182-5449194ATTGATTGATGG-6.62
Enhancer Sequence
ATAAGAGACC AGCGAGCTGC CAGTCATTTC TCAAGAGAAT CCTGAAGACA AACACCAAAG 60
TTGCACCCCA GATACCCAAC GACAAGGCAG AGAGCAAGCA AATCATGACT GACTGACTGC 120
CTGACTGACT GACTGACTTA CTTATTTGAT TGATTGATTG ATTGATGGAT GGATGGATGG 180
ATAGATGGGT GGATGGATAG ACAGACAGAG AGAAGGATGG ATGGATGGGT AGATAAGATA 240
AAGTACAAAG ATAAAGACAT GAATAAATGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 300
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 360
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TCTATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG 420
GATGGATGGA TGGATGGGTG GACAGGCAGA CAGACAGACA GACACAGACA GATAGAGAGA 480
AGGATGGATG GATGGATGGG TAGATAGATA GATAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA 540
CAGATAGAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 600
GATAGATAGC ACTTTTCTGT AACACTGTTG ACCGTTATCT TATACTTGTT TCCCCCATCT 660
TCTACATGTT TCCTAAACAG CAGGAAGAAC CGGCCGACAC CAGGGTGGAG TATAGACTCA 720
CTGGAGCAGT GTCACATTTA GGAAGCAAAC TGTTTTCTGG TAGGAATTGA CCACACATGT 780
TGAATTGTCT CATTTGTTCT GTGATTGAGC AGTTGAGGGT CCACCCGGCC ACAGAGTTAT 840
AGTCCAGTTT CTGTGTTACA GGACACTACA TAAGTCACAT TCGGGATCCA AGTGACGATG 900
GATGGCTGCG TTGCAGTGAC TTTTCCGTCA GGAAAACCAG CTGGACAGAA GCGTCCGAAG 960
AAATAAAGAG GAACTGCTAC ATGCTGTTCT ACATCAAGCG GTGATTAAAC GCTCTGTGTT 1020
TTTAACATTC AGAATGGGCT CTGTGCACAG CTAGAGTTTT AATGTTGTAT ATCTAACAGG 1080
CAGTGAAGAT CACAGATTTT TAAAGAAATC AGATCTTCCT TGGCGCTGCC TGGCTGAA 1138