EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13463 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr7:402024-403044 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr7:402317-402332GTGACCTTTGACCTC-6.04
HNF4GMA0484.1chr7:402318-402333TGACCTTTGACCTCA-6.55
NFYAMA0060.3chr7:402891-402902TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr7:402892-402907CTGATTGGCTGATAT-6.82
NR2C2MA0504.1chr7:402318-402333TGACCTTTGACCTCA-7.73
Nr2f6MA0677.1chr7:402318-402332TGACCTTTGACCTC-8.42
ONECUT1MA0679.1chr7:402140-402154GAAAAATCAATAAA+6.43
ONECUT2MA0756.1chr7:402140-402154GAAAAATCAATAAA+6.88
ONECUT3MA0757.1chr7:402140-402154GAAAAATCAATAAA+7.58
RREB1MA0073.1chr7:402768-402788TGTGTGTGTGTGTGTTGTGG-6.71
RXRBMA0855.1chr7:402318-402332TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr7:402318-402332TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr7:402318-402332TGACCTTTGACCTC-8.12
Enhancer Sequence
GAGTGTGTGG AGCTGATCAG TCAGGAGGAG AGATGAGTGT CACTCATACA CACACACACA 60
CACACATACA CTCATACACA CATGATGGAT GAGTGAGATC TGCAGACACT GAGAGAGAAA 120
AATCAATAAA ATGAGTAAGT GAAGCATGCA CACACACATA TCAGACACAC ACACATTCAC 180
TCACACACTC TAAGGCTCTC TTCGCAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 240
GTGTGTAATG ATGGAGTAAG AGCAAATCAG TGAGAGTGAA CAGACAGCAG GTCGTGACCT 300
TTGACCTCAG GGTCACTAAT GGACGCTGCT GCCGTCTGAA AGCGTCTGTC CTGCAGCGTT 360
TACCTGCCGC TCTGACACAC ACACACACAC ACTGAAGCGC ACGTGTGAGA GTTTGTGTGT 420
ATGAGTGTGA GAGGGAGAGT GTGTGTATCT ATTTATGTGT GTATGTGATG CATGTGTGTG 480
TGCGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGGAGT GAGAGAGCGA GAGTGTGTGT GTGCGCATCT 540
ATTTGATAAA TGAATGTGTG TGTATCTGAT GTGTGTGTGT GTGTTAGACA GAGAGTGTGT 600
GTGTGTGTGT ATGTCCGTGT GTGCGTGTGC ACGCATATAT CTAATGTATG AATGTGTGTT 660
GTATTTAATG TGTGTTTGTG TGTGTGCATC TAGCTGATGT ATAGGTGTGT GTGTATATTT 720
AACGACAGAC ACAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT GTGGAGGTGT AGCCCTGCTG 780
TGCTTCTGTT CTGTGTTTCC CGGTTAATAA TTGAGTGCGC AGGCGTTCCT CCTCAGACAC 840
CCGGAGCTGC GGTGTCTCTG CGCTGCCTCT GATTGGCTGA TATGAGGAGT GTGTGTGTGT 900
GTGTGTTTGT GTGTGTGTGT GTAAGTGCTT AATCATATCA ACTCTCACAG CAGCGTCTAC 960
ACACACTTCA GCTGAAACAG GAATAGTTCC AGTCTTTGAT TCTGATTGGA TCAACTGCAT 1020