EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13450 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:60087931-60089297 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr6:60089248-60089265GTGTTTGTTTATCTGCA-6.37
POU2F1MA0785.1chr6:60088235-60088247GATTTGCATAAT-6.22
Rarg(var.2)MA0860.1chr6:60089179-60089196CAGGTCACCTGAGGTCA+6.86
Enhancer Sequence
CATCAGACAG AAGAAGCTGA AGCTCCCAAA TTAAAGACAG CAGCATCTCT AACAAACACC 60
AACACAAACT GCACAAACAC ACAACAGCAG CAGCACTATG AAGAAGAGAG AGAGAGACTC 120
ACGGCTGCAG TGCATCTGAA CACACGGCTG CAGAACAGGA GGCTTCATCA TCCCACAGGA 180
CAGCAAACAC ACTGACACTG ACTCTAGAGC TGCACCAACA CACTGATGAA GAGGCGCCGC 240
TGGGGCAGAT GGGCCAACAC ACACACACAC ACACGGAGAG AGGGTCTAGA CTCTGAGCAT 300
GGAGGATTTG CATAATAACA AAAAGAGCAG GAGACAGCTG ATGGTCTGAG GACGTGCAAG 360
ACGAGCACAC GTACACACAC ACACTGTCCA CTCACACACA CTGTACACTC ACAGACACAC 420
TATACACATT ATACACACAC ACTATCACAA GAGACACACA TCACACACTT AAAGATCCAC 480
ATACACTCAG ACACATACAC ACCACATACT TACAGACAAA AGTAAATATT AAAAATACAC 540
ACAAACACAC ACACACAGAC ATAAATAAAA ATAAAATACA AACACTCAGA GACACACACA 600
TCACATATAT ACACACACAC ACACACTCAG AGATGCACAC AAACAGGCCA CCACATAAAC 660
ACTGATACAC TTACAGAGAC ACACATTTAC AGACACACAC ACGCACGCAC GCACGCACGC 720
AAACAGACCT CCACACACCC ACTCTAAGAC ACAAAATTCT CACACACAAA CACACATCAC 780
ATACAGACAC TATCCCACAT TTATGTACAC TTGCGTGCAC ACACACACAC ACACACACAC 840
ACACACACGC GCGTACGCGC ACACACACAC GCGCACACAC ACACGCGCAC ACACACACAC 900
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACATTACA CTGTTTGCAT TTTTAAACAT 1020
TCAGATAATA ATCATGTATT ATTTTTTATA TTTAATAATA TTTTTCTCTT GTGGAGGCCA 1080
GAAACCCAAT GTCAAATATA CCAAGCTTTA CTATCCTTGT GGGGACATTT GGAGCTGACA 1140
AAATGGCAGA ATCAAGTACA CACACACTCT CACTTCATAA CACACACACT CAGGGTGATG 1200
GAGGGGTCAC GAGGGCTCTA AGCTCCCCCC TCCCCCAACT CTCTCACACA GGTCACCTGA 1260
GGTCACAGTC GAGCCAGACA ACAGTCAGAC AGAGAGGAGG GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1320
TTTGTTTATC TGCAGTTTGG GTACACATTT GACCTCATAA ATGAGT 1366