EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13443 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:59669495-59672045 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr6:59671116-59671127TTTTATTGCTT-6.32
Hmx2MA0897.1chr6:59670441-59670458ATTTATTGATTGCTTGG-6.19
Hmx2MA0897.1chr6:59670765-59670782ATTTATTGATTGCTTGG-6.19
Hmx2MA0897.1chr6:59671204-59671221ATTTATTGATTGCTTGG-6.19
Hmx2MA0897.1chr6:59671061-59671078ATATATTAATTGCTTGG-6.65
Hmx3MA0898.1chr6:59670441-59670458ATTTATTGATTGCTTGG-6.17
Hmx3MA0898.1chr6:59670765-59670782ATTTATTGATTGCTTGG-6.17
Hmx3MA0898.1chr6:59671204-59671221ATTTATTGATTGCTTGG-6.17
Hmx3MA0898.1chr6:59671061-59671078ATATATTAATTGCTTGG-6.85
JUNMA0488.1chr6:59670812-59670825TGGATGATGTAAT+6.14
PBX1MA0070.1chr6:59670147-59670159TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr6:59670362-59670374TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr6:59670678-59670690TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr6:59671232-59671244TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr6:59671324-59671336TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr6:59671437-59671449TTTGATTGATTG-6.18
RORA(var.2)MA0072.1chr6:59671962-59671976TTGACCTACATTTT-6.57
SMAD3MA0795.1chr6:59671910-59671920TGTCTAGACG-6.02
Enhancer Sequence
TGCTGACAGT ATGCACCTGT GCTGATTCCA GCGGTCTTTA GTATAAGCAT GCTCTGATTT 60
AAAGCGTGTT AAACTTCATC CTTGAGCTGC AGATGATCAC AGAGAGCTGA ACAGATCTCT 120
TAATCCAGGT TGCTTTGTTA ATCCTTTTCT GTGGAATTGT TTATATGCGT TTCTATGGAC 180
GCATGTTAAT ACACTCCTGT CAATTAAAAA GTGGGTGGGG AAACAACACT TCTATGTCGC 240
GTTGCGGTGG GCCACTGGGA TTTGGATCCT GTTTAGGAAA TGTAGTTTAA AAAGAGACTT 300
GTTGTGTTTC CAGCAGTGTA ATATGACGGT GGACACACTT CTGTCCAAAC TGCACACAAA 360
TGAGGATTTA GCATCATCGC ATCCCTTTAA ATCAATACTG TGTTCATTTA TTTTGCTGCA 420
CATGCAGTGA ATTCGTTTGG CTGGTTGATT GATTTGGTTG ATTGTTTTGA TTGGATTGAT 480
CATTTGGTTG ATTTGCTTGG TTGATTGATT ACTTGGTTTG TTGATTGGTT GGTCGATTAA 540
TAGATTGATT TGATTTGATT GGTTAGTTGA TTTAGTTGAT TTGATCAATG TATTGATTGC 600
TTGGTTGATT GATTTACTGC TCGGAAGACT GGTTGATTTG ATTGGCTGCT TGTTTGATTG 660
ATTGCTTTGT TTGTTGGTCG GTCGATTGAT TTGATAATTT ATTGATTGCT TAAACAATTG 720
ATTGATTGGT TGATTTGATT GATTAGTTGA TTTGATTGGT TGCCTGGTTT GTTGGTTGGT 780
TGGTCGGTCA ATTGATTTGA TTTAGTTAGT TGATTGATAT GATTGATTGC TTGATTGATT 840
GGTTTATTGC TTGGATGGTT TGATTGATTT GATTGATTGA TTGATTGATT TGATTGCTTT 900
GTTGATTGGT CGGTCGATTG ATTTGATTAG TTGGTTGATT TGATAGATTT ATTGATTGCT 960
TGGTTAATTT GAATGATTGA TTGATTGATT GATTGCTTTA ATTGGTTGGA CTATTGATTT 1020
GATTTGATTT GGTTGCTTGG TTGGTTTGTT GCTTGGTTGC TTGATTGCTT GGTTTGTTGC 1080
TTAGTTTGTT GGTTGGTTGG TCGGTCAATT GATTTGATTT AGTTAGTTGA TTGATATGAT 1140
TGATTGCTTG ATTGATTGGT TTATTGCTTG GATGGTTGAT TGATTTGATT GATTGATTGA 1200
TTGATTGATT GATTTGATTG CTTTGTTGGT TGGTTGGTTG ATCGATTGAG TTGATTTGTT 1260
GATTTGATAG ATTTATTGAT TGCTTGGTTG ATTGATTTAT TGCTTGGATG ATTTGATTGG 1320
ATGATGTAAT TGATGGTTGA TTTGCTTAGT TGATTGATCA CTTGGTTTGT TGATTGGTTG 1380
GTCGATCAAT CGATTGATTT GATTGGATAG TTGATTTAGT TGATTTGATC GATGTATTGA 1440
TTGCTTGGTT GATTGATTTA TTGCTTGGAA GACTGGTTGA TTTGATTGGC TGCTTGGTTG 1500
ATTGATTGCT TTGTTTGTTG GTTGGTTGGT TGGTCGGTCG ATTGATTTGA ATGGTTGATT 1560
TGATCGATAT ATTAATTGCT TGGATGGTTG ATTTTATTGA TTGATTGATT GATTGATTGG 1620
ATTTTATTGC TTTGTTGGTT GGTCAGTCGA TTGATTTGAT TGGTTGGTTG ATTTGATTGG 1680
TTGATTTGAT AGATTTATTG ATTTGATTGA TTTATTGATT GCTTGGACTA TTGATTATTT 1740
GATTGATTGG TTGATTTGAT TGATTAGTTG ATATGATTGG TTGCTTGGTT GATTGATTGA 1800
TTTATTGCTT GGATGGTTAT TTGATTTGAT TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT 1860
GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTTGTT 1920
GGTTGGTTGG TCGTTCAGTT GATTTGATTG ATTGGTTGAT TTGATTACTT GGATGATTGA 1980
TTGATTGATT GATTGATTAG TTGATTTGAT TGGTTGCTTG GTTTGTTGGT CGGTCACGTG 2040
TGCATCAACT TAACACAGTG ATGGGTGTGT GGGTGTGTGC ATGAGTGTGT GTGTGTTTAT 2100
GTCTGCCATA GGGCTGCACA GAGAATGAAT CTTGCCCCAG CATATCTTTG AATGGAGAAG 2160
TTTCCATACA TGCATCACTG AAGGACTGCA TCACTGCATG ACTGCACTGC AAACCAGCTG 2220
CAGGACTTGT TGCGTTAAAT GCGAGTGCAG TGGCTTTGGC CGCAGCCTGG ATGAGCCACA 2280
GATCTGATGT GTAGTAGCCG TTAAGTGTGT TTGGATGTTC TTATTTTCTG GTCTTATTCG 2340
TTTATTTATT GTTTTGCACT TTTATCTTGT ATGTGTCTGA TATTTTGAGT TCATGTGGAT 2400
CTGCATGTTT GTGTGTGTCT AGACGGTAGG GGTGGGAATC TTTACGGTAT TCGACCCAAA 2460
ACTATTCTTG ACCTACATTT TTTTCTTTTT CTTTCTTTAG CTGTGCAAAT GCATCTTTCC 2520
AACTTCGCAT TTCTACCAAA ATTGGAGTTT 2550