EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13433 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:59379029-59380401 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:59379351-59379370TGTCCAGCAGGTGTCAGTG+6.27
KLF13MA0657.1chr6:59380211-59380229CTAAAGGGGGCGTGGTCA-7.22
KLF14MA0740.1chr6:59380214-59380228AAGGGGGCGTGGTC-7.64
KLF16MA0741.1chr6:59380216-59380227GGGGGCGTGGT-6.14
Klf12MA0742.1chr6:59380213-59380228AAAGGGGGCGTGGTC-6.3
SP1MA0079.4chr6:59380215-59380230AGGGGGCGTGGTCAT-6.46
SP3MA0746.2chr6:59380215-59380228AGGGGGCGTGGTC-6.29
SP4MA0685.1chr6:59380213-59380230AAAGGGGGCGTGGTCAT-6.98
SP8MA0747.1chr6:59380215-59380227AGGGGGCGTGGT-6.52
ZNF263MA0528.1chr6:59379048-59379069TTCTTCTTTTTCTCGTCCTCC-6.28
ZNF263MA0528.1chr6:59379051-59379072TTCTTTTTCTCGTCCTCCTCT-6.51
Enhancer Sequence
GGTCAGACTC TCGCTCTCGT TCTTCTTTTT CTCGTCCTCC TCTCCACACG ATGGCTTCAG 60
TCTGATACTC TTTCCTGCAC AGATTGTGTC TGTCGGAGAG ACTCGCCCGC CGCACCACTT 120
TCCTGGAACA CACACACGCA GAGACACACA TTCAGCTCAA CACATGCAGA TGCTCACACT 180
GATTGAGTAC ATGCAAAAGA AGATCCTCTT CAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 240
GTGTGTGTGT GTTTGTGTCT GGCTGTGTAT CTTTGCGAGT GTCCAGCAGG TGGTGTGTGT 300
GAGCACATGC AGTGAGTGTG TCTGTCCAGC AGGTGTCAGT GTATGTCCAA TATTTATGCA 360
GGGTATATAT ATTTGTGTGT GTGTGTGTGC GTCTGTGTGT GCGTGCTGGC ATTTGTGTGT 420
TCATGTTTTG ATATAGTCTT TGGGACTGTG CATTAATGTT TGTGTCTGAA TATGTGGTTG 480
TGTTCATGTT TGTGTGTTTA CGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTGCATG TGTTTAAATG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGGTTG TGTGCATGTT TGTGTGTGTT CATATGTGTG 600
TGTGTGTGGG AGTGTGAGTG TTTGCATATG TTCAAATGTA TGTGTGTGTG TGTGTGGTTG 660
TGTGCATGTT TTTGTGTGTA TGTGTGTTTT TGTTAGCTTT TTTCATGAGT GCATGTGTGT 720
CTCCATTTGT GCATGTGTGT CTCCATTTGT GCATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTACC 780
CGCGGCTGCC TGCGCTGCTG GTTCTGCGGC ACAGTGACGT TTTGTGCTTC AGTTGTGACT 840
TCATGATGAT GTCGTGTTTG TGCTTCAGCT CCAGAAGATG ATTCCTGAAC TCCTCATCCT 900
CACACAGATC TACAACCACA CACACACACA CACACCAAAT ATGCACCAAA TATTATTGTC 960
TATATTCACT GCCGCCTGTA TGGCTTCTTA CAGTGCTGAC TAGTGGTTTA AGTAGTGTGT 1020
GTTTAGGTGT GTGTGCATTT GTGTCTGAGT GTGCATGTGT TAGTGTATTT GCAGGTTTGT 1080
GCATATGTGT TTGAGTGTGT GTGCGTGTGT GCGCGTGTTT GCATCTGCTC ATATACTGTA 1140
GATGTGTGTG TAATTAGAGA AACTGATCAA AATATAAATC TTCTAAAGGG GGCGTGGTCA 1200
TTTATGCTGA GCACTGTGTG TGTGTGTTTG TGTGTGTATA ATACACAACA TTAGTCTGAT 1260
ATAATGAGCC AGACGCTCTG GAGTCTGTGG TTCAGACCAG AAACCTTCAG ATCAGAGAGT 1320
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT GT 1372