EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13380 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:56393363-56393972 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr6:56393799-56393812TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr6:56393796-56393809TAATAATTAATTA-6.18
ZNF263MA0528.1chr6:56393720-56393741TCCTTCCCCTCGCTCTGCTCC-6.16
Enhancer Sequence
GCTGAGTCAT TTTCGGTTTT GTTCTCGCTC TTTAGTGGGA TCGGGCGCAG CAGCCAGAAA 60
ACGGGGCGGG TCGGGCAGCG GGACAACAAA TTCTTAATAT AAGCGGGATC GGTCGGGTTC 120
GGGCTAAAAC CTGGCGGGTG CGGGCGGGAG CGGGATTTAA AATTTAGTCC CGCGCAGATC 180
TCTACACTGA GCTACCCTGT TAGGACTGCA TGTGCTATCA TATTAAAAGC AAATCAAAAT 240
TACCCTTAAC AACAGCCTCT TGTTGGTGCC AATGGCGTAG TGGAAAGTGC ACCGACACAT 300
GCACTCCGGT GTTCACGATG ACACGAGATT GATTCCTGCC TTGAAGTCCT ATGCCAGTCC 360
TTCCCCTCGC TCTGCTCCCC ACATTTTCCT GTCAATTCTC TCTACTGTCC TGTCAAATCA 420
AGGTGAAAAC CTCTAATAAT TAATTATTAA GAAAAACAGC CTTGCAGTAT AGCAGTATCA 480
ATATTAATAA CATTTTTGCT AGCATATGGT TCTTGACGTC AAACCAGGAC CGATGCAAAT 540
GTTCTTTTTG TGGTCAACAG TTTGACTGCT CTATGAATCA TTATAAGCCA CATGCGGAGT 600
CCTATTATC 609