EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13343 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:54107019-54108803 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr6:54107202-54107213AATGAGTCAGA-6.32
Foxd3MA0041.1chr6:54107760-54107772AAACAAACAAAC-6.32
NR2C2MA0504.1chr6:54107159-54107174GCAGGTCAAAGGTCA+7.16
NR2C2MA0504.1chr6:54108757-54108772TGACCTCTGACCTTT-7.82
Nr2f6MA0677.1chr6:54108757-54108771TGACCTCTGACCTT-7.28
Nr2f6MA0677.1chr6:54107160-54107174CAGGTCAAAGGTCA+7.73
RREB1MA0073.1chr6:54108463-54108483CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr6:54108461-54108481CCCCCCCCCACACACACACA+6.38
RREB1MA0073.1chr6:54108465-54108485CCCCCACACACACACACACA+6.95
RXRBMA0855.1chr6:54108757-54108771TGACCTCTGACCTT-6.55
RXRBMA0855.1chr6:54107160-54107174CAGGTCAAAGGTCA+7.31
RXRGMA0856.1chr6:54108757-54108771TGACCTCTGACCTT-6.58
RXRGMA0856.1chr6:54107160-54107174CAGGTCAAAGGTCA+7.52
RxraMA0512.2chr6:54108757-54108771TGACCTCTGACCTT-6.62
RxraMA0512.2chr6:54107160-54107174CAGGTCAAAGGTCA+7.58
SOX10MA0442.2chr6:54107568-54107579AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr6:54107568-54107578AAAACAAAGG-6.02
TCFL5MA0632.2chr6:54108093-54108103TCACGCGCAC+6.02
ZNF740MA0753.2chr6:54108459-54108472CCCCCCCCCCCAC+6.92
Enhancer Sequence
TGAGAGGAAC TGGACACACA CACACCCATC ACCGCCCGCC TCCCGAAAAT GGCAAAGTCA 60
CATCCTTGAG CGGCAGGAGA GATCAGAGGC GCAGTTTTCC TGTGCGTTAT CGGTCCATCA 120
GACACTCCTA TAGTAAACCT GCAGGTCAAA GGTCAAGCTG CAGCTTCATT GAGGACAGTG 180
ATGAATGAGT CAGATTGGTG AGGATGAGAG TCTTAAGGTA AGATCTTCAT ATGACAAGCA 240
AACACTGAGG CCTGTGTGTG TGTGTGTATG TGACTTTCAA AAAGTATAGT TATTACTGTT 300
TTACATAAAG ATACACAAGC AAACACATAC AAACAATCGC ACACACAGAC ACGCACACAC 360
AAAAACACAG AAACTAACTC ACTTAGAAAC TCACATACTC AGACACACAC ACACACACAC 420
ACACAGTATG CACGCAGACA CACTCACACA CACAGACACA AAAAACAAAC ACAAATATGG 480
ACACAGACAC ACACACACAC AGACAAACAT ACACACAGAA TTATACACAG ATATGCACTC 540
ACTCACACAA AAACAAAGGA ACTCACTCAC ACACACACAC ACAAACCCAC ACACATACAG 600
TATGCACAAG GACACTCACA CACTCAAACA CACACACACA CACACACACA CGCACACACA 660
CACACTCATA TATGCAAACA CACATCTACA AACATAGACA CACGCACTCA CTCACATAGA 720
CACACTCACT CTCACACACA CAAACAAACA AACTTACACA AATATCTGCA ACACATACAC 780
ACACATGTAG AGACAGAGAC AAAAACAGGA GCTCACAAAA ACACAGGAGC TCACACACCC 840
ACACACACAC ACACAAAAAA CCCAGGAAGT CACTCATACA CTCAATCACA CACAGAGACA 900
CATACCGTAT GCACACAGAC ACACACTCAT TCACACAGAC ACAAAAAACA AACACACATA 960
GAATTACACA GATACACACT CACTCACACA AAAAACACAG GAACTCACTC ACTCAAACAC 1020
ACACACAAGA CACATTCAGT GTGCACACAG ACACACACAC TCACACATCC ACACTCACGC 1080
GCACACACAC ACACACACAC AAATAAAACA TATATGCACA CACAGGCATT GTCTCACACA 1140
CACTCACACA AACACACACA CACACACAAG ACATATATGC ACACACAGAC ACATATATGC 1200
ACACAGACAC ACTCTCACAC AGAAATATAC ATATATGCAC ATAGACAACC TCACACACAC 1260
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACAGAGTATG CACACTCAAA 1320
AACACAGCAA CTCACTCAAA CACACATACA TACATACACA CACACACACA CACACACTTA 1380
TTCACTCACA CAAAGACACA TTCATGCACA CTTACTCACA GTAACTCTCT CACACATACA 1440
CCCCCCCCCC CACACACACA CACACACACA CACCCCTGCG GGCTGCTGTA ACCTTCACAG 1500
GTCTCCTCAT CAGACTGACT CCTCCAGCAG CTCCTCCTCT TATCAGTGTC AGTGATTGTG 1560
CGCAGAAATG GCATCCTGTC GCCGCTTCCT GTATTCCGTT CACACGGGCG GGACGAAACA 1620
TTCCTAAAGA CGTCACAGAG ACTGAAACAC ACCTCTGATA AAGCATCTCA GCCTCTGATC 1680
GGGAGAAAAA ACCTTACAGC GGTGATCTTC AGAGAGCAGA AACACATTAA ACAGATTCTG 1740
ACCTCTGACC TTTCAGTGTC TGCCACACCC CAACACCCAG AGCC 1784