EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13313 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:52350104-52350638 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr6:52350246-52350257TATGTAAATAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr6:52350234-52350245AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr6:52350235-52350248ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
POU4F2MA0683.1chr6:52350237-52350253TTAATTAATTATGTAA-6.53
POU4F3MA0791.1chr6:52350237-52350253TTAATTAATTATGTAA-6.35
PROP1MA0715.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:52350233-52350244TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TAGGGTACAC GTTAATAAAA CACAATTTAA TGGATAATTT AATAAATAAT ATAAATATTA 60
CTCGTTATAA TTACTGTTTT ACATTACTGT GAGGGTCGGG GTAGACGTTA ATAAAACACG 120
ATTAATGGAT AATTTAATTA ATTATGTAAA TAATTGTCGT TAATTTTCGG CTGCAGCTGT 180
ATCCCTTCTA GCAACAACTC GTGTTTTTGT CCCCAACCAC AAACCTGCAT AGCAACAAAA 240
CACGCCTCTC CTGTCAATGT GGATTTCTCA GCCAATCGGC ATTGAAGTTC GGCGTGACGT 300
CACGTTTGTT GACACTTCCA GAGCGTTAGC TAAAACGTCA CTGCAGCAGC GCGCGCCCGT 360
GACCCTCGCC GTCCACCCTG CGTTTTCTGC CTGGAAACAT CGCGAACTAA TCGGTGAAAC 420
GCTGGATTCC GGGGGCTGGA GCCGGTGTGC GGTAAAGTCC TGACGTGTCT CGGCTCGTTA 480
ACACACAATA TTGATCTGTT TTTGTCCCAG TCACGCTGAC AAACGCTCTC TAAG 534