EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-13129 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:33384978-33386247 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:33385811-33385832GTTTGCTTTTTTTTTCATTTT+6.35
NFYAMA0060.3chr6:33385514-33385525AACCAATCAGA+6.62
NFYBMA0502.1chr6:33385509-33385524CTATCAACCAATCAG+6.39
Enhancer Sequence
CCTTGGCAAC TTCCTGGCAA CACCTTAGCA ACTGCCTAGC AACAACTTAG CAATCACCTA 60
GCAACACTTT TTTTTTGTTT TTAAAGATTT TTTTTGGCCT TTTTGCCTTT ATTAGATAGG 120
ACAGTATTGA GACAGGAAGC GAAGTGGGAG AGAGAGAGGG GGTAGGGTAG GGAAATGTCA 180
TCGAGCCGGG ATTCGAACTC GCGACGCCCT GACGTGCTAT TGCACCATAT GTCGGCGCGC 240
TAACCACTAG GCTATTGCGC CGACTACTTT AGCAACCAGC TAGCAACACC TTAGCAATCA 300
CCTAGCAACA CCTTAGCAAC CTCTCAGAAC ACCTTGGCAA CCATTGAGTA ACCCCTTAGC 360
AACCACATAG AACAACCAGG CAACCATCTA GCAGAGCCTT AGCAACCACT TAGCAAATGA 420
TCTAGAACAC CTTAGCAACC ACCTAGCAAC CTCTTAGCTA CCACCTAACA ATAACCACCT 480
AGAACACTCT AGCATCCACT TAGCAACACC TTAGCAACCA CCTAGAACAC CCTATCAACC 540
AATCAGAATA CCTTAACAAC CACCTAGCAA CACCTTAGCA ACACTTTAGC AACCACCAAG 600
CAACACCTTA GCAACCACCC AGCAACCTTC TAGCAACACC TTAGCAACCA CATAGAACAA 660
CTAGGCAACC ACATAGCAAC GCCTTAGCAA CCACCTAGCA ATGAGTAGAC ACCTTAGCAA 720
CCACCTAGTA AAGCCTTAGC TAGCACCTAG CAACCATTCA GAACACCTTA GCAACAACCC 780
AGCAACACCT TAGTAACCAA CTAAACTCTC TAACAACCAC TAAGTATTTG GTTGTTTGCT 840
TTTTTTTTCA TTTTAGTCAT TGCATTTTCA GATTCAGCTA ATTAAAGTGA GGAATAAATA 900
TTCTTTTCTC GGTTAACAAG CGTGGTTTTA GTTTTATGTT TCAAATACTA TCTGAAACAA 960
TAACTCTATT GTTGTGAGAC TGAGACTGGA CTTTTATGTG GCATATCTAC CATGCTGCGT 1020
GTGAATATGA CAACCTGACT GTTCCCCAAG GAGTGATGAG ATGTGGGTTT ACAGTCAGTC 1080
ACCTAATCAG GGAATTTGGT CTCACTGGTG GGATTTCTCA TCATGGTCTC TCTGTTCTCT 1140
GACAGGCCCC TGTGGAAAGG CAGATGTTGT GGAGCAGTGT GCTCTGCCTG ACCCGTCCCC 1200
AGTTGTAGTG CTTCGTCTGA CGGAGGCTCT GGAGAGACTA GGTGAGTTTG CTCCTCTACC 1260
TCACCCAAT 1269