EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:16000766-16002976 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr6:16002741-16002752GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr6:16002741-16002752GTTTTATGACC-6.02
Foxd3MA0041.1chr6:16001681-16001693GAATGTTTGTTC+6.14
Foxd3MA0041.1chr6:16002293-16002305GAATGTTTGTTC+6.14
Foxd3MA0041.1chr6:16001291-16001303AAACAAACAAAC-6.32
LHX2MA0700.1chr6:16002153-16002163GTTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr6:16001586-16001599AGATAATTAATTA-6.62
PHOX2AMA0713.1chr6:16001593-16001604TAATTAGATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:16001593-16001604TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr6:16001593-16001604TAATTAGATTA-6.32
ZNF24MA1124.1chr6:16002516-16002529TGTTCATTCATTC+6.3
ZNF384MA1125.1chr6:16002701-16002713TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
TGTATAATTA GAGCGTTTGC AAAAAGACAT GTTAAGACCA AAGGAATAAG AGGTGCATGT 60
GATCACACCG CTGCCTGAGC CCTACAGTCA AATCCTCCAC TTACAAAAGC CTTCACTGCT 120
TTCCCACTGT GAATTATCTC TCTTTTCTCC TCTACCACTG CCCCCCTCTT TCCCTCTTTC 180
TCTCTCATTA GTGTTCATTT CGGACTTGCC TGACTGGAGA ACGAGCGCTG ATTGCATTAA 240
TATTCATGAC AATAATTAGT ACATGTATTA TGGGTCACTG AATATTCATG CTATTAGTTT 300
GGTCCTCCTG CTGGTGTGTG TGTGAATGTG TGTATTTATG TGTCTGAAAA GGGGTCTTTA 360
ACACTCCTTG GGGGGCTTAA GGATTGTTGA TCCAATAAGT GTTATACGAA TAACTAAACA 420
ATAACTTAAT TGTTTAACTC ACTACTAATG AAGAACGCAA ACTTGGCCCA TTATACAGAT 480
ATTAGGACAC ATCAATTTGT TTCTAGAATA TAATTTTTTC TTAAAAAACA AACAAACAAA 540
AAAAACTACA TGACAGAGAC AGACAGAGAA ACAGATAGTT AGTTAAACAG ACAGACAGAC 600
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 660
AGACAGACAG GCAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 720
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 780
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAATTAA TTAGATTAAT 840
AAATTGATAG ACAGATAGAC ATAGATCAAT TGATCAATCG ATAGTTAGTT AGTTATTCAT 900
ATTGATAGAC AGATAGAATG TTTGTTCAGT TGTTTAATCA ATGGATAGAT GGATGGATGG 960
ATGGATGGAT AGATAGTTTG ATAGTTAGAT TGATAGATAG ATAGTTTGTT AGTTAGTTAG 1020
ATTGATAGAT AGACAGACCG ATTAATTGAT CGATCGATAG TTAGTGAGTT AGTTAGTTAA 1080
TAAGTTAGTT ACATAGTTAG ACAGATAGAT AGACAGATAG ATTGTTCATT TGTTTGTTCA 1140
TTTATTCGTT TGTTCGATCG CTCAATTGAT CATTCGATAG ACAGTTAGTT AGTTAGTTAG 1200
TTAGTTAGTT AGTTAGTTAG TTCGATAGAT GGATAGATAG ATGGATGGAT GGATGGATGG 1260
ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGACCC ACGGGCGGGC GGACAGACGG 1320
ATAGATAGAT AGTTAGTTAG ATTGATACAC AGATAGATTG ATAGTTAGAT AGATGGTTAC 1380
TTAGATGGTT AATTAGTTAG TTAGATTGAT AGACAGATAG ATTGACAGAC AGACTTTTCG 1440
ATATATAGAT AATTAGTAAG ATGGATAAAC AGATAGATAG ATAAATTGAT CAATCGATAG 1500
TTAGTTATTC ATATTGATAG ACAGATAGAA TGTTTGTTCG ATCGATAGAT GGATGGTTGG 1560
ATGGATAGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGGTGCATGG ATAAATAGTT TGACAGTTAG 1620
TTTGATAGTT AGTTCGTTAG TTAGTTAGAT TGATAGACAG ACAGACCGAT TAACTGATCG 1680
ATCAATAGTT AGTTATTTAA TAAGTTAGTT ACATGGTTAG ACAGATAGAC AGATAGATTG 1740
TTCATTTGTT TGTTCATTCA TTCGTTTGTT CGATCGCTCG ATTGATCGTT CTATAGACAG 1800
TTAGTTAGTT AGTTAGTGTT GGAAGACCAA GAACCAATTT TAAATGAATA AATATATGCA 1860
TAAAAACTTA TACAAACAGA TAAGACACAA GAACAGATAT GTCAATTAGT ATTCAGAAAG 1920
GCAAAGTAAT AAAAGTTTTT TTTTAATAAA CTATATTATA GGAAATAAAA TAAAGGTTTT 1980
ATGACCTAAT GACAAATATG TTTTTTATAC ATTAACAATA AAATTAAAAA CAAATAGCAA 2040
ATCTAAAACC AAAACAAAAA CGTTACATAG ATGACAAAAC CCCCCCCACC CCCCAGAAAG 2100
CATCATTATA TTACCTGGTG CCTGTCCAAG CTGCATGTTG CTCATGTCCT TGGTCAGGCC 2160
ATTGGTTTTG GGACTGGGAG CAGCGCATGT TGAGATGGCC CTTGGAGGCC 2210