EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12879 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:11630828-11632932 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:11632847-11632868ATGCTAAAAGTGAAAGCAGAC-6.37
PKNOX1MA0782.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX1MA0782.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA+6.74
PKNOX2MA0783.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX2MA0783.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA+6.62
RREB1MA0073.1chr6:11631840-11631860TGTGTGTGTGTGTGTGGGGT-6.41
RREB1MA0073.1chr6:11631844-11631864TGTGTGTGTGTGGGGTGGGG-6.68
SNAI2MA0745.2chr6:11631679-11631689TGCACCTGTT-6.02
TEAD1MA0090.2chr6:11632181-11632191ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr6:11632181-11632191ATGGAATGTG-6.02
TGIF1MA0796.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA-6.74
TGIF2MA0797.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA+6.62
TGIF2MA0797.1chr6:11632251-11632263TGACAGATGTCA-6.74
ZNF263MA0528.1chr6:11631983-11632004GCCTCTTGCCCTCCCTCCTCT-6.51
ZNF263MA0528.1chr6:11631305-11631326GAAGGAGCGGGAGAGAAAGGA+6.56
ZNF263MA0528.1chr6:11631991-11632012CCCTCCCTCCTCTCCTTCTCT-6.68
ZNF263MA0528.1chr6:11631347-11631368AAAGGAGGGAGGGAAAGAGAG+7.09
ZNF740MA0753.2chr6:11631858-11631871GTGGGGGGGGAGA-6.24
Enhancer Sequence
GGAACTACAA CAGGGGGACC ATGATTATCA GCCAATATTA TGATCATTTC CAAATGACGT 60
AATATCGATT TAGTCTTCTG TTACTAATCA AGACCAGTAG AGACAACATG AGTGTTTTTC 120
CATCATATCT GGCTATTGTT TACAGCTCAC AAGGGTCTTG AGTGTCAGGG GGGAGGGACG 180
GATGGTTTGG CGTGCAGATG GTCCAGAGAA GAGGGGGGCA TTGTGTCTGC GTGTGGGTGA 240
TGTGCACGGA GATATTTAGT ATTTTATTGG TCTGTTCCAG AGGACCCAGC TGCTAGGTCA 300
TTCCCTGCTG GCACACACGG AGAGGGAGAG AGATGGCGAA GGAAAATACA GAGAAAGAGG 360
GGGCATTAGT GTAGATGTCG ATGCGAGCAG AGAGGATTTA AAGCACAGAG GAGAGAAGAA 420
AAGTGAAAAA TCAGAGCTCG GATGAGAGGG AGTGAGACGG AGAGGAAAAA AGGGAGGGAA 480
GGAGCGGGAG AGAAAGGAAA AGAGAGAAGA GGGGAAAAAA AAGGAGGGAG GGAAAGAGAG 540
ATAAGCAGCG AGCGAGTGAA ATGTGTCCGC CGTGATCCAT CAGCCCTGCA GCCACACTAA 600
TCACAGGTGG AATTCAGCGA GCTCTTTAAA ACGCTGCCTC TCATTTCAAA CCCTGCCCTC 660
AGGCTGTCTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTTA GAAGTGTGTC AAAAATCTCT CTGCTTGCCC 720
TATTTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 780
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGCATATTT 840
CTGCATGTGT GTGCACCTGT TTGTGTGTGT AAATCCCCCA GAGACAATAT CTGGCTCAAA 900
CGGCTCCAGT GATCACAGAT TGTGCCGTTA CTCTGTGTGT GTGCGCGCGC GTGTGTGTGT 960
GTGCAGAAGA GAGATGGAGC GCAAAGGAGA GAGGTGTGAG TGTGAGTGTG TGTGTGTGTG 1020
TGTGTGTGGG GTGGGGGGGG AGAGAGGGCA GAGCGTCTTT GTGTCTCTAC CTATCCCATC 1080
ATCCCGTTCA GCTCAGCAGA GGTGACACCA AGGTGAGCGT GAGCGCTCTC TCTCCGTCTC 1140
CATCACACCA GTACTGCCTC TTGCCCTCCC TCCTCTCCTT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 1200
CTCTCTCTCT CACTGTGCCT CTCTGCATGG CTCAGTGGCA GATGGAGGCT GTGTCAGCAG 1260
GGAGAAATGG CCATTCACAC ACTCCTTACA CACACACTTT CCCCTCCTCT CTCTCTCTCT 1320
CTCTCCCTCT CTGACTCTTT TGCTCTGTCG GGAATGGAAT GTGTTTGCCG TTACAGATAG 1380
CTGATAATTA CCTGATACTG AAAAGAAGTA AAAACTCTTG AATTGACAGA TGTCAATAAT 1440
ATTTGTCTGT CTGGCTGCTT GTTTGTCTGC ATCTGTCTGT CTGCCTGCCT ATCTATCTAT 1500
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1560
CTATCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT 1620
CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT 1680
CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGGGTTTTA TGATCGATAC AACACCATAC AACATGCCAT 1740
TTTATTTGAA CTGAATTTGA TTCAATTTGA ATTTAAACAT AACATGTCCC AGCTGCACAC 1800
AACACGATGC TGCTACACAC ATTAAAACAA TCCTTTTTTA TGTTAAAAGG AGTTTTTGTC 1860
CTAACCAAAA CCAGCAGAAT TTATTTTTCT GCGATGTGGC GGCTAAAACA GCCTAAACTA 1920
CCACGACAAT GATCACCTCA GGTGATAATT ATGTGCTTTA CTCTGTGTTA AAAATGATCA 1980
GTTTGAGTTT GAATAACATT TTATGCAACA TTTAACGTCA TGCTAAAAGT GAAAGCAGAC 2040
AGATTGCATC AGATCTTGAA ATTTAAAAGC ATTTGAAAGC ATTATGTGCA ACAAATATAA 2100
GTCG 2104