EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12820 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:5457787-5458732 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr6:5457955-5457967ACAATGTAAACA-6.04
Foxd3MA0041.1chr6:5458298-5458310GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr6:5458302-5458314GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr6:5458306-5458318GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr6:5457846-5457867AGTTGGTTTCAGTTTTGGTTG+6.2
IRF4MA1419.1chr6:5457849-5457864TGGTTTCAGTTTTGG-6.08
IRF9MA0653.1chr6:5457850-5457865GGTTTCAGTTTTGGT-6.29
ZSCAN4MA1155.1chr6:5458675-5458690AGCACACACTTTAAT+6
Enhancer Sequence
ACTAGTGTTT GTGTTTGTTC TGTCAGCAGC GCGCTGCTTT ATTCTCGGCG CCTTCGTCTA 60
GTTGGTTTCA GTTTTGGTTG GCGCTGAGAT GAAGCATGCG CGTTGCTTAT GTGTGAGCGC 120
ACGGTAAGGT GTTAATCTAT CGTGTAAACA TCGGGCCTCG TGCAAACCAC AATGTAAACA 180
TCGGGCCACG TGCTTTTTGT CGTGTGCTTC AGTGTTGTGC TCGTCTTGTC ATGAACATGC 240
GGTTGATGAG TTCTCTCATT GGCCGCATGT TCTTGTCATG TGAGCACATG GCTTGTGTTG 300
TCTCTCTGTG TCATGCGCTC TCCCGTCTAT TGTCTAGTCC CACCCTCCTT GTTAACCCAT 360
TATTAGTTAA TTGTTCATCT GTTTTTTGTT AATTTCCTAC AGTTTATAAA CCCCTTATGT 420
CTGCTGTCCT GTGCGAGTTC GTCATCATAT GTTGTCGATG TTTACCTGTC CTGCTGTGTC 480
CAGCCCTGCC TTGTCGTGCC TGCCCAGTCA AGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TTATTGTTTG 540
TTGTAGTAGT GTTTTCCCCC TCGGGGTTGT TTATTTTTGC CTTTTATTTT ATTTTTTAAT 600
TAATAAATCC TACTTCACTC TGCGCTTGGG TCCTCGCTCC TTTTTCCCTT CACCGATCGT 660
GACAAATACA TTTTGACAGA TTTTTGTTCA TCATGATGTT TGTTTAAAGA CATTTTTTTT 720
CAAGATGTTT TATCACGCAG ACTATTCTCT CCAGAATGTA ATTTATAGAG TCCAAAACTG 780
GGTCTTTTAT TCTCATATCA TCAATTCTTA ACCCAAAAAG ATACATGCAT GCACTATGCT 840
TTCAAAAAGG CTTTTGTTTA GTTTCTCGGT TGTTCTCTAA ATATTTACAG CACACACTTT 900
AATTTATGCT GAGAGCTTAT TACAAAGGTG TCAGCTCATG TTCTC 945