EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12794 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:3889244-3890658 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:3889670-3889691TTTCTGTTTTGCTTTCTCTTC+6.14
IRF1MA0050.2chr6:3889664-3889685TTTTGCTTTCTGTTTTGCTTT+7.21
ZNF24MA1124.1chr6:3890081-3890094CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
GAATGCTCAC TTTGGGGGAA CTGTTAGTTT AAATAAGACT GTAATCATAC AGTACTTCCA 60
GGCAGTGACC TGTCAAAAGT CATGAACAGG GCCATTTTTC CCTTTCAAAT GTGACCTAAA 120
GTTTCCTACA TGCGCATTAG AACAGTGAGT TTAGTGTGAG TGATTTCATG AGCGAGGGCA 180
GGAAAACACG GCATCTGTTT TCACAGGGGA GCAAAAACAG CACAGTGTAT TCAAATAGCC 240
AGTTCCTAAA GCCAAAAGTT CGATTCCAGG TCGTGCGACA CATGAATTGT AGATTTTCTG 300
AGATCTCCAA CTATGGAAGT GCTCTTGATT GAAGCACTTA ACCCGAGCTC GACCCAGGAG 360
GGAGACGGTC TCTACAAATA ATGTACTACA AATCGCTTCG AATGAATATC TGCACCGTTC 420
TTTTGCTTTC TGTTTTGCTT TCTCTTCACC GCTTGTTCAC CTTCATTCGC ATTTGTCTCA 480
ATCCTATCGA AATTGCTTTA ACATAACTCT TTCTGCTGGG GCATCCCACT GTTTTGTCTG 540
TTTTTGGAGC GTTGCAAAGG AAGATGAATG GCGCTCTGGC TGATGGCTTT AAAGGTTAAG 600
AAAATGTCAG AACAGCAGAG CTATTAGTCT CCTGTGCTCT GACGGACCCT TGAAGGGCCG 660
CTTACTCCCT CCTGAGATGC GGGATATGAT CTATGTGTGT GGGTAATTGC TGTTGTGTTT 720
GTTTTGTCCG ACAGGTCAGG CTGGGACTTG TGCTCTTTTC TCCGTCTGGT TTCAGGATTG 780
ACATTTCAAT TTGTCACTTA GTTAGTAAGG GGCTGTTCAC ACAGAATGTG TTTTTCTCAT 840
TCATTCATTT TCCTTAGGCG TAGTTCCTTA TTTATCTGGG GTTGCCACAG CTGAATGAAC 900
CGCCAACTAT TCCACCCATA CACTCCCTCA TTCACACACA CTCACACACT ATGGCCAATT 960
TTGTTTACCC AGTTCACCTA TACCACATGT GTTTGGACTG TGGAATGCTT TTTCATTCCA 1020
ATGCAATACT TTTTGCTGGT TTTTCTGTGT GAGTGTGCTC TTGATGGATG TGTGTGATGA 1080
TTACACTTAT ATCTTGTGTC TTTTGCATTG ATTTAGAGGG AGGGCAACTG TTTTTTATTC 1140
GACGTCAACA TAGTGGAGGC ACTAGTTATT TATTTTTTTT ACCCTTTTTG ACCGACTGCT 1200
TATTGTGTTT TTAACCCTTG TGTGCTGTTG GGGAGGTTTT CATCTACTCT GAGGTGATTT 1260
TGAGTCTTAA TTTGGCTGCA ACTTTCTCTG TGTTTCAGCA AATTGAATGA TTGTTGGTGA 1320
CAAATCTTAT TCTGACACAT ATTTTGGGAA AATGTTTTGA AAATTTTCAA CAATTCACTC 1380
TGGACAAATT TACTACCCTT TCGTTATGTT TGAG 1414