EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12784 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:3220520-3221525 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr6:3220671-3220683TTTGTTTATTTA-6.18
FOXE1MA1487.1chr6:3220671-3220686TTTGTTTATTTACGG-6.13
HOXA10MA0899.1chr6:3220592-3220603AGTAATAAAAA+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:3220687-3220702TGATCTCTTGATCTC-6
Enhancer Sequence
ATCCATCCAA GATATCCATC TAATACAACC TTCTCTCTTT CTATCCATCT AGCTATATCT 60
ATCTATCTAT CTAGTAATAA AAATATAATT TGTGTGCACT TAAAAAATAT CTGTTAATTA 120
ACAGGTTCTG TTTTGTGATT CACAAGTGTT TTTTGTTTAT TTACGGATGA TCTCTTGATC 180
TCTTCTCTTC TCAGTCGACT TTTAATGTTG AAAATTCAAC TCTACGGTTT AACAAAGTGA 240
CACTTATTGA CATTGTAGTC ATATTTGAGA CAAGATGCTG TTTAAAAAAT AATATATAAT 300
AAAATAAGTC TGTAAAATAA CACAAAATGT ACTAGCGACT TATTACAAGG TTTTGTACCA 360
TAAATTACTA CAACAACCCA GACAATATAT CACTTTAAGC CAATAAAAAT GTCTATAAAA 420
GTCACTTTTC CGAAACTTTC GTATCATTGT TCCATAATGC AATTCAAAAG CATAATTAAG 480
TGGGGGGAAA ACATGAATCA CAAAATACGG AAAACTGTCC ATTTATAGGT ATTTTTTAGT 540
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCTGT 660
GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTGG ATTCATGCTA AAGAATAACA 720
CAAAGGCCAC ACGCAGGTTC TGAGAGGTTT GTGGGAGATC AATTGAGTCT GACTGTATCC 780
TGATAAGGTT AATGGCTGAG ATTGGTTGCC GTGTCTTTAG AAAGTCTCTA TACAGCGCCT 840
TTTCCCATGG GCTGCAGCTT GACTTACTCT TTCTCTTTCT AAAAACACAG ATAACGTGCC 900
TTCAGCCTAC TGTATCCATT AGTATTCCCA GCGCCATTCC AAAATCCATT AGGACTAAGA 960
AAGAAGTGTA CATTCAGAGA GGACAAGAGG GAGAAAAGAA TCTCT 1005