EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12744 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:1041293-1043201 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr6:1042343-1042363TGTCTGTGTGTGGTTTGTGT+6.21
RREB1MA0073.1chr6:1041708-1041728TGTGTGTTTGTGGTTTGTGT+6.4
RREB1MA0073.1chr6:1041822-1041842TGTGTGTTTGTGGTTTGTGT+6.4
RREB1MA0073.1chr6:1042078-1042098TGTGTGTTTGTGGTTTGTGT+6.4
RREB1MA0073.1chr6:1041623-1041643TGTGTGTGTGTGGTTTGTGT+6.94
RREB1MA0073.1chr6:1041769-1041789TGTGTGTGTGTGGTTTGTGT+6.94
RREB1MA0073.1chr6:1041893-1041913TGTGTGTGTGTGGTTTGTGT+6.94
RREB1MA0073.1chr6:1042011-1042031TGTGTGTGTGTGGTTTGTGT+6.94
RUNX1MA0002.2chr6:1041713-1041724GTTTGTGGTTT-6.02
RUNX1MA0002.2chr6:1041827-1041838GTTTGTGGTTT-6.02
RUNX1MA0002.2chr6:1042083-1042094GTTTGTGGTTT-6.02
Enhancer Sequence
TTCTGAATGC ACGTTAATTT CAGCAGTTTT TATTTCTCAG AGAGTCACGT AGGCACTCTG 60
CACTGTAAAG ATGAATCACT TATTAAATGC GGAAGGGGGA CAAATGCATG CTGTGCATAA 120
TTATGTACAT TAATGAAACA TGATGCGCGG ATGAAGCCAG GTTGGAGTCT GGATTGCTAA 180
TTGTCTACCT GTGCTGTTCA ATCATGCTTG AGGTCTGACT GATCTACACA CACTGAAGTG 240
TTCATGATGA TGTGCAGCGC TTTTACCTGG AGAACTCAAG AGAAGGACAC TCACAGCAGC 300
ATCCAGATCA GCTACCTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGGTTTGTGT ATATGCATTT 360
TAGTATTTGT ATGTATAGGG GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 420
GTTTGTGGTT TGTGTATATG CATTTTAGTA TTTGTATGTA TAGGGGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGTGTGGT TTGTGTATAT GCATGTTAGT GTGTGCATGT ATATGTGTGT GTGTGTTTGT 540
GGTTTGTGTA TATGCAGGTT AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 600
TGTGTGTGTG TGGTTTGTGT ATATGCATGT TAGTGTGTGC ATGTATAGGT GTGTTTGTGT 660
GTGTGTGTGT GGCTTGTGTA TATGCATCTT AGTGTGTGCA TGTATAGGTG TGCGTGTGTG 720
TGTGTGTGTG GTTTGTGTAT ATGCATCTTA GTGTGTGCAT GTATAGGTGT GTGTATGTTT 780
ATGTGTGTGT GTTTGTGGTT TGTGTATATG CATGTTAGTG TGTGCATGTA TAGTGTGTGT 840
GTGTGTGTTT GTGATTTATG TATATGCATG TTAGTGTGTG CATATATAGG TGTGTGTTTG 900
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTGTGTGTG TGTGTGTGGC TTGTGTATAT ACATCTTAGT 960
GTGTGCATGT ATAGGTGTGT GTGTGTGTAT GTGTGTGTGT GTGTGTGGCT TGTGTATATA 1020
CATCTTAGTG TGTGCATGTA TAGGTGTGTG TGTCTGTGTG TGGTTTGTGT ATATGCATGT 1080
TAGTGTNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1140
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNCTCA CAAGCACACA 1200
CACATGCATA TACAAACACA TAGATATACA CACTTACACA CAGATGCACA CACAAACCCA 1260
TGCACAAAAC ACACAAACAC ACACACTCAC ATGCACACAC AAACACATTC CCACAAACAC 1320
ACATACACAT TCGCACACAA ATGCAGACAC AAACACACAC ATACATGCAA CATGCAACTA 1380
CACACACACA CAAGCGCAGA AGTACACACA AGTGTGCACA CACATAAATG CACACACAAA 1440
CACACACTCA CATGTATACA CACAAACGCA CACAAACACA CACTTTTATG CGCACACACA 1500
CTCAGACTCA CTCACAATCA CACACACACA CTTGCTCACT CACTCACTTA CACACTCACA 1560
CACACGCAGG GAAGATGATA GAGGGAAATG GAGAAGGCCG TTGGGGACTC GCCAGCAGAG 1620
TAACACTATT GGATTACTGT CCCCGGTGAA TCAATCTCTG CCCGTCTCTC TCGCTGCTTA 1680
ATTACTGGGA TTTTGGGCTG TTCCTCCGCG GGACTCTGCT TTTCTGCAGG GTGGGTTTAG 1740
GGAGGTCTCG ACACCCTAAT AACTCTCTCC TGGATGATCT CTGTCACTGT AATTTTCCTT 1800
TAGAGACTCT TCAGGGTCAC AGGGCCAATC TCACATTCAA TTCTCTTTAC CTTGAGTCTT 1860
GCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACATACAC 1908