EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12732 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr6:502745-504367 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr6:502911-502922TTAATTAATAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr6:502908-502921AAATTAATTAATA+6.37
POU6F1MA0628.1chr6:502910-502920ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:502910-502920ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACTGTCTCT 60
CTGAGTGGTC TGTCCATCTG TCTTTTGTGT TTGTCTGTCA TTCTGTCTCT CCGTCTGGAG 120
TCTCAGTCTG TCTGGATCGT GTTTAAAGAT TAAAGTTCCA CTGAAATTAA TTAATATCAT 180
GATCTTTAAC ACTTTGTAGA CCATTTCAAT GTGGATTTGT GTGTGTGTGT GTGTTTGCGC 240
AGGTGGAATC AGCTGGATCT GGCGATTGTT CTGTTGTCTG TGATGGGAAT CATTCTGGAG 300
GAGATTGAAA TAAGCGCTTC ACTTCCCATC AATCCCACCA TCATCCGCAT CATGAGGGTC 360
CTGCGCATCA CCCGCGGTCA GCGCTTTATC CAGCACATTA CACATCACAC ACACACACAC 420
ACACACATAC ATTACACACA CATATGTACA TATATACACA CACACAAATA TACACACACA 480
CGCACGCACA TACAGACATA CAAATAAACA CACACACATT AAACAAACTC AGATATATAG 540
TGTCATGCAC TTATGCACAC ACACACAAGT GCACGCATAC ACACATTCTG TGCATACTAC 600
TGTGCATTAT GTGCTTACTA CACACACACA CACACACATA CAGACATGTA AACATACATA 660
GACACACACA AACATACACA CGCACATGCA CAAACTCTCT CTCACACACA AACACATTCT 720
CTCTCTCTCT CTCTTCTCTC TCTCACACAC ACACACACAC ACCATTTCAT CTACATACAG 780
AAACGTGCAC ACATACTGTT TATACACTTG CGCACACATA CACACACACA ATTACATGCA 840
TACACGCATA TTGTGCATAC TACACACGCA TACATACTCA TACACACACA CACACTTACA 900
CACAAATACA GACATAGATA CACATACACA CACACACACA CACATGCACA TACTATTAAT 960
ACACATGCAC GGATACATCC ACACACACAC ACACATACCG TGCATACTAC ATATACACAT 1020
ACATACATAC ACACAGACAC ATATACATAC ACAGATACAC GCACTCCCAC ACACACACAC 1080
AAATAATTAA ACATACAAAT GCGCACACAC CCAAACACAA ATAACAAATG CACACACACA 1140
CACTCACATG CAAACTCACA CACTCATGCA GACACACATT CACTCACACA TACATGCATA 1200
TAAACACACA CATTTAAATA ATTAAATACA CAAACACACT CTCACACACA CGCACGCATG 1260
CACACACTCC CTCTCACACA CAAACATACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1320
AAAGCACAAA CACACACATG CACAAACTCT TTCTCTCTCA CACACACAAA CACACTCTCA 1380
CACAAGCACA CACACACACA CACACACGGC TTCTAGATAT GAAATGCATT GTAATGTCAG 1440
TTTTGCTATG TTAGATATTA TTAATAACAC TCTTGAGGCG GATGCCTGTG TAGTGGGAAG 1500
CTCTCCTGTC TCACTCAGTG TGTCCTTTGG TGATTGTTTC TGTCTCCGTC TCACAGTTCT 1560
GAAGCTGTTA AAGATGGCCA CCGGGATGCG GGCTCTGCTG GATACTGTGG TGCAGGCTCT 1620
AC 1622