EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12698 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:71122380-71124278 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr5:71122521-71122532TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr5:71122520-71122533TTGATTAAATTAG-7.82
Gata4MA0482.1chr5:71123844-71123855TCTTATCTCTC+6.32
RFX1MA0509.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC+6.71
RFX1MA0509.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC-6.72
RFX2MA0600.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC+6.6
RFX2MA0600.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC-6.8
RFX3MA0798.1chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC+6.36
RFX3MA0798.1chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC-6.62
RFX4MA0799.1chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC-6.43
RFX5MA0510.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC+6.44
RFX5MA0510.2chr5:71124082-71124098TGTTGTCATAGCAACC-6.59
Enhancer Sequence
GTGCATTTAT AATTGTGAGA TCAGAGCAGT AAAGCTGATC AAAGTACACA GTAAACTCCT 60
AAAGTAAAGA CACGGCCTCA TCACAAAGTC CCTCAGTAAG CTCATCATCA GCCCTGACTG 120
CGGTGGGAAT TATTACACTG TTGATTAAAT TAGCAAAAGC AATCACAATC TCTTAAAGCC 180
AGTTAATTGG GAGAATTTAT TTACCCGCGC TGACGGCTTT ATGCATGTTT GATGAAGTAT 240
TATAAGGTTT GTTTTGGNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 300
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNCTC 360
TGGCCGGATG ACAAACACAC AGGATGCGGA CGCAGAGCGA CACATAAATC TGCAGGAGCC 420
GCGCTGGAGA AGTTACACAG AGGTCAGAAC AACTTTATGA GGGCAAACAC ACATATACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACTTAC ACACACACAC ACTTACACAC 540
ACACATATTT GCACAAACAC TCACACACAT ATTCAAACAC AAAATTACAA ACGCATATTT 600
ATACACTTAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACTCAC GTATTTGCAC AAACACTCAC 660
ACACATATTC CAACAAAATT ACATACGCAT ATTTACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACACACATAT TCACACAAAT ACACACATAT TGAAACACAA AATCCTACAC ACTCACTCTT 780
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT ATATATTCAC ACATGCACAT 840
ACAAACACAC ATATTTTCAT ACACAAATAT TACCTTACAC ACACACACAC ACACACACAC 900
ATTCAGAAAC TCACTGACAT ATTGACACAC ACACACATTT TCACACACAC ACACCCACAC 960
ACACATACAC ACACACACAC ACATGTATTT ACATATATAT TTACACACAC TCACGCACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC ACACACAAAC ACACACAAAT ATGTGCAAAC ACTCAAACAA 1080
ACTCGCGCAC AAACGTATTC CCACACATCT TTATCTATCA CACACACACA TTCTCTCACA 1140
CACATAGATT TACACACACA TTCACACACA AACACACACG TGTTCACAAA CGTGCGCACA 1200
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1260
CACACATATT CACATACAGA TATTCACACA CGCACAATCA CACATCTTTA AACGCGCATA 1320
CACACATATT CATACAAACA CATATTCACA TACACATATA TATTCACACA CACACACACA 1380
TTCACTCATT TACACGCACA TATTTACACA CACGCACACA TACATATTTG CTCAAACACA 1440
CTCACGCACA CACATTCACA CACATCTTAT CTCTCACACA CACACACTCA CAAATACAGA 1500
ACACACACTT TTACATACAC AATTCTATTA CGCACCCACA CACAAATTCA CACTCAAACA 1560
CACTCACACA ACACATATTC AGACACATCT AACCTCTCAC ACATATACAC AAACACGCAT 1620
GAACACACAC ACACACACCA ACACCAATGT TCACCAAAGC GTGATCTGAA AAACACGTGT 1680
CTGCGCCTTT AAATTGTCCG GCTGTTGTCA TAGCAACCGT CGGACCGGTA TGTTTTGCGA 1740
CAGACCGTGT TCCGCGCCGC AGCACATCAT GAGATGAATG CAGCATAAAT GCATGTGAGT 1800
TTCACCCTTT ATTATACATT TGACCACATA TAATGTGCAT TTATATACTG TAATATACGC 1860
CGTGTGTGCT GATAAACGAG TGCTAGTGCG ATCTGCGC 1898