EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12592 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:64278060-64279174 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr5:64278294-64278315CTAAAGAAAGTGAAAGTGAAC-7.56
IRF7MA0772.1chr5:64278297-64278311AAGAAAGTGAAAGT+6.29
PRDM1MA0508.2chr5:64278303-64278313GTGAAAGTGA-6.02
Enhancer Sequence
GTTGAGGAGG GGGATTGGTA AAATGAGATG TGTTCCCTAT ATGCAGTGCC TAATTTGTAA 60
ATTGCGAGGT CCCGGAACCG ATCAGGGTAA TGGATCCAGC ATGTTACCCA AATATGGAGA 120
GGTGTCGCTT GTGAAAGTTG AGAGGGGGGG TTGATGTTTG ATGGCAGAGG GGTGTCGCAT 180
GACGTGGAGA GCGGGGGGTT GTTGCGGACG AAAGTGAAGA AGGTTGTGGA GTCGCTAAAG 240
AAAGTGAAAG TGAACAGCGG ATGAGGGAGG AGAGCAATTG AGGAGAGGGA TCGCTAAAAT 300
AAGGTTCTGG ATCAGATTTT GAGAGGTCCC TGATCCGGAT CCGACGTGTT CCGGTACAAA 360
TTGAACCCAA TGTGTAACGA TCACCAAAAT GAAGGTAAAA TTTACAAAAT ACTATTACTC 420
TTTGCTATAA TTGCCAACAA CTCAAACACT CTTTTGATTA CGGACCTGTT ATTATTGTCG 480
GTGGTCCTCA TAGGGGCCTG CGAGGTGTTT TTCTTGGGTG TCTCGACCAG ATCTGTGTCA 540
TTGGTGGCTG AGGTTTTGGC TTCTGACTTG ATTTGACTCT GATTCTGATG CTCTTCCACA 600
GAAGCTGAGC CGGTGAGGTT TCCCACATTC ATCACTGTCT GAGTTTCTCC ACTATTACGG 660
GAAAAGCTTT GAGCGTGTTT AAGCTGGCTC TGAGAATAGG AATCTGCTGC CGAAGGGCTG 720
TTTGTGTTTG TATTCATTTG TGGAGGTGCT TTGGTGAGCT GCTCTGTTGG CTGAATTTGT 780
GGATGTGTGT CCTGTAGAAC TGTAGTCTCT TTGAGCTGGG TCAGTGGTGT AGGTTTGACA 840
CGAACAGGGG TTGGTTTTTG TGTCTGCACA GGCTCTTTCA TGTTCTCATT ACTTTCTATG 900
CCAATGCCAC TTGACTTAAG TGAAATTCTC TCTGTAGTGT CTTGGGTAGA TTCAGGATTC 960
AAGTATGTTG GCGAGTCCTC CACAAAGGCA TTTAACACTG GACCAAAGAT TAGAAAAGAA 1020
GAAAAACATA AAATACCATT TTTCTGTCAG AATAAACATT TAAACAGGAT TTGTTAACCC 1080
AAAAATGAAA ATTCGATCAT CATTTTCTCA CCCT 1114