EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12410 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:46455603-46456538 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr5:46456442-46456455TAATTAATTAACT+6.64
Lhx3MA0135.1chr5:46456439-46456452AAATAATTAATTA-6.71
NFYAMA0060.3chr5:46456068-46456079TCTGATTGGTC-6.14
POU4F1MA0790.1chr5:46456437-46456451TTAAATAATTAATT+6.01
POU4F2MA0683.1chr5:46456437-46456453TTAAATAATTAATTAA+6.25
POU4F3MA0791.1chr5:46456437-46456453TTAAATAATTAATTAA+6.3
Enhancer Sequence
ACAGAAATCC ACCAAAGGCC CCTGTCAACT GACTGACTGA CCAATCAACT GTCCCACTCT 60
TCTAATTCCC AAATTTGCAA GCTACCCAGG GGCCAACCTT TCTCCCTGGA AGGGAAGAGA 120
AGCGAAGAGA GGCATGATGT TTCCTGGTTA TGTGAAGCTG ATCCGCCAAT CACAACACAT 180
TAGGAGTGCT GACTAATCAG AGCACTTTGA GGGCGGGCCT TATAGTAGGA ACCAGGAATT 240
GTTATGGTAA TTTTTCCATA TTTGCTCAGT AGCTGTATAA ATGAAGGTAA GATATGTGAC 300
TATACAAATA ACATGATTTG TTTTACACAA AATGCTAACA AAATGGTGAG AGCTGGTGAC 360
ACACAGGCTG TTTCAATCTT GGATCAAATA CAACTCCCAA TAAGATTTTA TCTGCCTTTT 420
ATTACACAGC TGTTTGATTG GTATACTAAA ATTCTATGCT ATAATTCTGA TTGGTCAGTC 480
ACAACATGCC AAGGTATGTT ATTCCCACAT AACAACTGCT GAATAACACA GGCTTATCTG 540
GGAACTTTGA ATCACCCTGG TCGTCAATGA ATACGTTCAA ATTCAAATAC TAACATCCAG 600
ATTCACATGT ATCTGCTTGA CTGTCATGCC ACTGTTTTTG ACTCTTTTGG ACTTTTTGGC 660
ACTGTCTTGT TAATGAACAT GGAGGTCAGT ATGTGCTTCA TTCAGCTGGG TTTGTTTCTG 720
TCAGCTTTGC GTTTTTGACT GATTGGTACC ATCTTGTGAC TGAATAATGT GCGGGTTGGA 780
AAATGCTCCA TCAGCTACGC TCAGCCGGTT AATTTCTGTA AGCTATGCAC TTAATTAAAT 840
AATTAATTAA CTTTTATGTC TGCTAAATCT AATTAGCAGA TAAGCTTGTC ACACACATCC 900
ATATATCATA CCTGTCAACT CTCCCCTTTC CCCCC 935