EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12203 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:29476575-29477588 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE22MA0818.1chr5:29477497-29477507ACCATATGTT+6.02
GSX1MA0892.1chr5:29477575-29477585TTTAATTAGG-6.02
OLIG3MA0827.1chr5:29477497-29477507ACCATATGTT+6.02
PHOX2AMA0713.1chr5:29477572-29477583TAATTTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr5:29476788-29476801ATTATGTAAATTT+6.54
PROP1MA0715.1chr5:29477572-29477583TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr5:29477572-29477583TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr5:29477572-29477583TAATTTAATTA+6.62
Twist2MA0633.1chr5:29477497-29477507ACCATATGTT+6.02
Enhancer Sequence
GACCGATCGA GGATCAAAAC ATGACATCTC TGGATAGAAA TTTAAAACAT GGACCAATCG 60
CTCGCTTTTT TCAATGTCTA GTCATCTTGT TTAATCCCGC ACCTTTTCAC AGCTTCGCAC 120
GACAGAATTT CGCACACACA AACTCTAGAG TGACTGCAGC TTAAGAGTTC AAATTACTTT 180
GGTAAATCTT TGTTTTAATG GTCCTCTTTA GACATTATGT AAATTTGCAA CAAATCAGCT 240
GTAGCAGTCA TTATTCATTA GACTGTATGC ATATTTGCTT TGATGGTACC GCAGTCAGAC 300
ATTCACCTAC ACTATATGTA ACTGCAAGCA TGTCTATGAG GTGCCGTATA GGATTTAAAT 360
CAAACTTTGC TTATCAACAC ATACATAAAA CACGTGTATA TACACCTATA AATTACTCGC 420
ATATACACCT CTACTACTGG ATGTTAAAAA CAACATGGAT GAAACTTGTG TATATACATA 480
TAAACTTGAT GCATAAATAC ACCCAAATAC ACACGCACAT ACATATAAAC TCGATCCTCA 540
CATAAACACC CACATTAACA CACGCACATA CATATAAACT TGCTGCATAC AAACACACCT 600
ATACACACTC ACATATACAT ATAAACTCGA TTCTCGCATA AATACCCACA TTTACATGCA 660
CATACATATA AACTCGAAGC ATGCAAACAC ACCTATAGAT ACTCGCATAT ACATATAAAC 720
TCGGTCTATG CATATACACC TTCAACAACA CGCGCACATA CACAAACTCA CTGCATGCAA 780
ACACACCTAT AACATCTCGT GCAAACATAC AAAAAAAATA AATAAATAAA ATTCACAAAC 840
ATTTATCACG AATCTGGTTA TTGCAAAGCT TAGGAAATAG AAATAATGTG ATTAATAGAG 900
GGATTAAATA TGTTAAATTA TGACCATATG TTATATAAAA TATTAGTCTA TATAAATAGA 960
CTATTCAAAA TAAGAAATAT TTTTATTTAA AACCTTTTAA TTTAATTAGG TAA 1013