EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12196 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:29128682-29129468 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr5:29128718-29128728GCAATAAAAC+6.02
NR1H4MA1110.1chr5:29129335-29129346GAGGTCATTGA-6.14
NR2C2MA0504.1chr5:29129327-29129342GAGGGTCAGAGGTCA+7.34
Nr2f6MA0677.1chr5:29129328-29129342AGGGTCAGAGGTCA+6.93
RXRBMA0855.1chr5:29129328-29129342AGGGTCAGAGGTCA+6.87
RXRGMA0856.1chr5:29129328-29129342AGGGTCAGAGGTCA+6.68
RxraMA0512.2chr5:29129328-29129342AGGGTCAGAGGTCA+6.73
ZNF384MA1125.1chr5:29129406-29129418TTTTTTTTTACA-6.07
ZNF384MA1125.1chr5:29129403-29129415TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr5:29129404-29129416TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
TTGTCCCTCC TCAAAGTAAC AGCAATAAAA GAACTTGCAA TAAAACGTCC TCCCACATGC 60
ACCTTCAGTA GTTTGTTGTT GCTATTCTGT CTGTTTTTTA TTTTTTATTT GAATCAACAG 120
CCCAGTTCAG TTTTAAGCCC TTTTAGACAA ACTGGTTAGT GCAAAAGCAA TGATAAGCTT 180
GTTGGAGCCA TGCATACATG ATTTGTAGTA GAAGAAATTG CTCTGCTCAC TTATAATGCA 240
TGCCTCATGT GCTGATGACA AATTTATGTC ACATGAATCC GAATGTATAC TCAAAATGAA 300
AGTAATTTGG GCTTAAACCT TAAGAACAGC GGTTCTGATC CAAAGAGTCA ATGTTGACAT 360
GTTTGACTGC ACCACTGTTA TAACTTTTCA ATCTTAGTTG AAGCTCACAT GTGGTTGAAA 420
AAGCAAGTCT AGAGAACAGC TGTGAGAGAA GAATGGCTTT CTCTTTATCT CTTTTTTTTT 480
CTCCCCTCCC TCTGAACAAT GAGAGCCATC TGACAACAAT GAGCGAATGT TTCTGCCAGC 540
GCTCAGTCAG TCCTAATCCT GATTTAATGT CCTTTTCCCT CATCACCACC AATGGGCTGC 600
TTGTAATCCT CTGTCTTGCC TCCCCCCTTG TTAGCAGCCT CATTTGAGGG TCAGAGGTCA 660
TTGACAGGGA GGGTTGATGT CATTAGTGTG TTGAACCATT AACACTTTTA TGATGCTCCT 720
GTTTTTTTTT TTTACATCAT TTAATATAAT GCGCTTTTTC AATATCGTTT CTGGATTGTA 780
AAATGT 786