EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12161 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:24951237-24951907 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr5:24951815-24951825GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr5:24951815-24951825GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr5:24951815-24951825GCTAATTAGT-6.02
PBX2MA1113.1chr5:24951876-24951888CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr5:24951873-24951890GGGCCTGTCAATCACAC-6.48
Enhancer Sequence
TAATTAATTT AGTTGGTTCC TGCACATAGT TAGTAATCAT AGGAAAAAAG AAAAATGTCT 60
ATCATAATCT ATGCAAAAGT TATTCTATTC CATTTGATGA GAGAACGGAA CCACTTATGG 120
GGGGATTGGG CCTGTACAGT CCTTTAAAAT TTAAAGAATG CAAAAGTAAA TGACGTCACG 180
AACCCGGAAC ATCTAAACAT TGAATTATCA GTTTAACAAC AGATAAAAAT AATCATACTT 240
CACATCATCA CTGTATTTTT GATAAAATAT GAAAAAAGAT AATCAGTCTT AGTGCTAAAT 300
AATATCAACT TACAATACAC AATATAAAGA AAACACCACA ACAAACTGAA GGCTATAATT 360
TACAGATCAA TGGCTGTAAG ATATTAATGA GGGTCAAGCA CACAGGACTG CCACATTGTG 420
ACAGAGAAAC ACTCTCATAC CCATGCTTAC ATGCAGTGTG TTTTCTAACA CACTCTAATT 480
GATTCTCTAT TAGCAGTTAA GAATCCCCTG AGTAAACCTC CTTCACAACA TAATCAATAA 540
CGCGACAAGA TCCACAGCCA CGGGCTGATT AACCCCCTGC TAATTAGTGA CCATCTCACA 600
CCTCAATCTC TCCAGCTCCA ATCAGAACAC CCGGAGGGGC CTGTCAATCA CACACATGGG 660
TCTACAGTCA 670