EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-12069 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:17895407-17897155 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr5:17896755-17896772TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr5:17896754-17896771ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr5:17896755-17896772TGAATTAATTAATTAAT-6.7
DUX4MA0468.1chr5:17896405-17896416TAATTTAATCA+6.62
DUXAMA0884.1chr5:17896404-17896417ATAATTTAATCAA+6.98
Hmx2MA0897.1chr5:17896956-17896973GCAATCAATTAATCAAT+6.83
Hmx3MA0898.1chr5:17896956-17896973GCAATCAATTAATCAAT+7
Lhx3MA0135.1chr5:17896756-17896769GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr5:17896757-17896770AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:17896760-17896773TAATTAATTAATC+7.34
ONECUT3MA0757.1chr5:17895778-17895792AACAAATCAATAAA+6.12
PBX1MA0070.1chr5:17895743-17895755CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr5:17895818-17895830CGATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr5:17896678-17896690CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr5:17896981-17896993CAATCAATCAAA+6.18
POU6F1MA0628.1chr5:17896758-17896768ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:17896762-17896772ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:17896758-17896768ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:17896762-17896772ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr5:17896913-17896924TAATCAAATTA+6.02
Six3MA0631.1chr5:17896025-17896042ATAGTTGATACCCTTTC-7.15
ZNF24MA1124.1chr5:17895922-17895935CATACATTCATTC+6.37
ZNF24MA1124.1chr5:17895934-17895947CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr5:17895926-17895939CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr5:17895930-17895943CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr5:17895495-17895507TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr5:17895496-17895508TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TAAACACTTT TGTAAATTTA ATGCAGAAAT CAAAATTAAA TGTTTTTGGT TTTACTCAGC 60
AATAATAACA ACACTTCTGG ACTTTTAATT TTTTTTTTTT TCACACAGCT CCGTCGGTCG 120
GTCGGCACAT ACATGCACAT ACTCTTTTAT CCTGTGTCTT TTCCTTATTA ATTCTCTCTA 180
GCTTGTTCTT TTCTTTCTTT TCACTTTTAC ATGAGCTGCA GATTTACAGC TGATAATCAA 240
AATCGGTTGG TCGGATAATC AAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 300
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAAATC CATTCAAATC 360
ACCAGCCAAA CAACAAATCA ATAAATCAAC CAATCAAATA ACCAAATCAA TCGATCAATC 420
AAATTAAATC AACCAACCAA CCAACCAACC ATCTAATCAA TCAATTAAAT AAATTAACCA 480
ACCAACCATT CAAATAAGTC AACCAACCAA CCATTCATAC ATTCATTCAT TCATTCATTT 540
ATTTTTTTGG CTTAGTCCCT TTATTAACTC GAGGTCGCCA CAGCGGAATG AAAGGCCAAC 600
CTATCCAGCA CGTTTTACAT AGTTGATACC CTTTCAGCTG CAACCCATCT CTGGGAAAAC 660
CAAGCAACCA ATCAATAAAT CAACCAATCA AATAAATCAA TCAATTAACT AAATCAAATC 720
AAATAAATCA ACTAACCAAC TAAACAATAA ATTAAAATAC AATCAACCAA CCAACCACAT 780
AAATCAACCA ACCAACCACC TAATCAATAA ATTAAATAAA TCAACTAACC AATCAAATAA 840
ATCTAACCAA CCGATCAATA AATCAACCAA CCAAACAACT AAAATCAACC AAGCAAATAA 900
ATTAATCAAC CAACCAATCA ATTAATCAAC CAAACAACCA ACCAACAAAC CAAATAAAAT 960
CAACCAACCA ATCAAATAAA ACCAACCAAC CAACCTAATA ATTTAATCAA CCAACTAATC 1020
AATTAATCAA CCAAACAACC AACCAACAAA CCAACCAACC AATCAAATAA AATCAACCAA 1080
CCAATCAAAT AAATCAGTCA ACTAATTATT TTTTTAATCA ACAAAATTAG ATTTTTTCAC 1140
ATCAACCAAC CAACTAACCA ACTCAACCAA TCGATCGATC GATCGATCGA TCGATCGATC 1200
GATCGATCGA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC 1260
AATCAATCAA TCAATCAATC AAAATTAAAC AACCAACTCA AATCAATTAA CTAATCAAAT 1320
AAAATCTACC GACCAACAAA TTAGTCAATG AATTAATTAA TTAATCAATC AATCAATTTA 1380
AGAAAATCAA CCAACATATT AAAAATCAAC CAATCAATAA ATCCAAATCA ACCAACCAAC 1440
CAAATCAATC AGTTAATCAA TTAATCAATC AATCAATCAG TCAATCAAAT CAAATCAAAT 1500
CAAATTTAAT CAAATTAAAT CAAATAATCA ATCAATCAAC CAACCAAAAG CAATCAATTA 1560
ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAAATCAA TAAATAAAAA TAAATCAACC AACCAAATAA 1620
ATCAGCAACC TAACAATCCA ACCAATCAAT GAATCAATCA ATCAATAAAT TACAAAAAAA 1680
TGCAATCCAA ACAATATTCA TAGTCATATG AATCTCATTG TCAATACAAA TACACTAACA 1740
ATCATCTG 1748