EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11929 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:7104722-7105612 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF2MA0051.1chr5:7105374-7105392GGAAAGTGAAACTGCAAT+6.22
PBX2MA1113.1chr5:7105285-7105297GCTGTCAATCAA-6.32
PBX2MA1113.1chr5:7105305-7105317GCTGTCAATCAA-6.32
Enhancer Sequence
AAATAAAAAG GATATAAAAT GAAATGTAAT AAAATGTATT CAATTAAAAT AAAATAATAT 60
CACAATAAAT TAAATAAAAT AAAAGAATGT AAAAAAAATA ACCATAAAAA GCAAGAAAAA 120
TAAATGACTT AAATGTTTTA ACTGCTATCT AAAAATGCAG AAACTTGTTT TTTGGGATCA 180
GATGTACTTT AGGCCTCTCT ATAGTAATTC TAATTAGCTT AATTAAATAA CAATAGAAGT 240
CAACGGGGTG TACCCATATA CACAGTGAGG TGCACATGTG AGCTTGTGTG TGTTTGAAAT 300
AACACATCAA CACTCACAAC ACACACACTC ACAACACACA CACACACACA CACACACACA 360
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 420
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACACACA ACCAGAATAA GCAAAACCTT TAACCCCAGC CAAAACTCAA 540
GCAGATCAAT CAAGCCCAAC ACAGCTGTCA ATCAAATCCC AGAGCTGTCA ATCAAAGCAG 600
CAGGGGTCTG GAGATAATGA GTGAAAAGAA GATGATCAAT CCAGCGCATG CAGGAAAGTG 660
AAACTGCAAT GAGCCGAAGA AAAGATGCGG CAGGATAATA GACGGAGAGC GGACAAAAGA 720
GAGCTGCAAC TGTGTCTTTA TCTGCTGGCC TTTGTCAAGC AAAGAGCGTT CATCTGAATG 780
GCTCTGAACT CAATCAAAAT CTCCCTTTTT TTTCTCTCTG CGTGTCAGTC TGATGGCTGA 840
ATAAAACCCC TGAGGACGGA GATTTTCACA CAAAGAGATA CTTTTCATTC 890