EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11810 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:270612-271733 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr5:271089-271106AGGTCATCTTCAGGTCA-6.87
Rarb(var.2)MA0858.1chr5:271089-271106AGGTCATCTTCAGGTCA-7.17
Enhancer Sequence
TCTGTGCTGT ATGGAGCAGG TCAGTTCAGG TTTATTACTG TATGATAGAT AGTCATATTG 60
ATGAGCTCTA TAACTGATGA GGACACTGTA GTCTAAAGCC TTCATGCTGC ATCTGTGTCT 120
GTTCTTATAG CAACCAGAAG ATGAGCTTTA AGGGGTCAGA GGAACGTTAG CAGAACAAAC 180
ATTGGCTGGT TCACTGCATG CCCCTCCCCC TCATTATCAT ACGAGGATCA CAGACACGCA 240
TGGAACTTTA GGATTGGACA TGTTTCCGCT GTAATGGGAA GTGTTCCAGA GGTGTGTGTG 300
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT 360
TATCTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTTAGGA GCAGACACTC TGATGACAGG CTGACGCTTC 420
CTTTCTCATG CGTATCTGAC GACTGTTTCA CGCACATCAG CCTCTGTGGA GCACAACAGG 480
TCATCTTCAG GTCACAGAGA GCCACAGACA GCTCACACAC ATACACACAC ACACACAGAC 540
ACACACACAC CATGCATACA TACACATACA CATTGATATA TGTGCATGCA GACTACATGC 600
ATACAGCCAC ACACACACAC ACACACACAC ACATACACAC ACGCATGCAC GCACACACAC 660
ACACACACAC ACGCATAAAC ATGCATACAT ACACATACAC ATTGATATAT GTGCATGCAG 720
ACTACATGCA TACAGCCACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACGCA 780
CACACACACA CACACAGTTG AAGTCAGAAT TATTAGCCAC CCTTTGAAAC GTTTTTTCTT 840
TTTTAAATAT TTCCCAAATG ATGTTTAACA GAGCAAGGAC ATTTTCACAG TATGTCTGAT 900
AATATTTTTT TCTTCTTGAG TATGTCTTAT TTGTTTTATT TCGGCTAGAA TAAAAGCAGT 960
TATTAATTAT TTAAAATCCA TTTTAAGGTC AAAATTATTA GCCTCTCTAA GCTAATTTTT 1020
TTCGATAGTC TACAGAACAA ACCATCGTTA TACAATAACT TACCTAATTA CTCTAACCTG 1080
CCTAGTTAAT GTAATTAGCT AAGCCTTTAA ATGTCACTTT A 1121