EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11804 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr5:112529-113671 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr5:113533-113544GACCAATCAGA+6.14
POU1F1MA0784.1chr5:113353-113367TTTATGCTAATGAG+6.64
POU3F1MA0786.1chr5:113354-113366TTATGCTAATGA+6.22
POU3F2MA0787.1chr5:113354-113366TTATGCTAATGA+6.44
Pou2f3MA0627.1chr5:113352-113368GTTTATGCTAATGAGA+6.39
RREB1MA0073.1chr5:113105-113125ACACAACACACACACACACA+6.19
RUNX1MA0002.2chr5:113030-113041AAACCACAAAC-6.02
SP1MA0079.4chr5:113384-113399AGTGGGCGGGGCTTT-6.69
SP2MA0516.2chr5:113383-113400TAGTGGGCGGGGCTTTC-6.98
SP4MA0685.1chr5:113382-113399CTAGTGGGCGGGGCTTT-6.42
ZNF384MA1125.1chr5:113145-113157TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr5:113146-113158TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
CTCTAGGAGG AGATGGTGTT TGATTTTTAG TCTCAGAAAA AAAATTGGAT ATTAGTAGTC 60
TGGCTTGCTT TCACAAACCA GCCTAATAAT AGCAATAATA ATAACAGCAA CTATATATAA 120
CTATATTTTT GTGAGGTAAA AAAAATGAAA AGGGGGGCTC TTAGATTCGC TATAGCCCCA 180
GGGCCCAAAG TGTTCTTAAT CCGGCCCTGT GTGTACCTGC CGTGTGGACA GAAAGATGCA 240
GATACGAGAT ATGAAACACC AGCAGTAGTT GGCTAATATA TCGGGTGGAT AAGTCTGTAA 300
ATCTGACCCT GAAAGAGTCG TGCTTCACCA GCCACAAACC TCACCGCACA TCACTGACAC 360
ACACAGAGAT ACACACATGA GCATTACACC TCAAACCACA GCACTCACAG CACTCGCACA 420
CACACGCACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACACACACA CCACAAGCAT CAAACCACAA ACCACAGCAC ACACAGACAC ATAGAGACAC 540
ACACACACAC ACACACATAC ACACACACAC ACACACACAC AACACACACA CACACACACA 600
CACACACAAA CATTTGTTTT TTTTTTAAAT ATGGTACAAA AACATTAAGA TGAGACCTGC 660
GCCTCATCCA CTCAACCACT GGTGAGTTCT TAAAGGCAGA GTTCAGCAAA CACAACATCT 720
CCTCATAATC ACCTGCAGCA GCTGAACTCC ACATCTATAA TGCTCTTAAT CTAAACACTC 780
TACTGGCTAA TGGACAGACG GCTGCTTCTC ACTCAGGGCT GCTGTTTATG CTAATGAGAT 840
GGAGAGATGG GCACTAGTGG GCGGGGCTTT CCTCCTCTGA TGACACGTAC AAAGGGAGAA 900
TGTCGATCAG ATCACTGCAT CAGGGTGATT TCTGCTTAAT AAGCTTCCTT TAACTGTCTT 960
AACCAGCAGC ACTCTGGATC AGCCGATCAG CTGACATCAG CTTTGACCAA TCAGAATAAA 1020
TCTGCGCATC ATAGAGTCCA ACACTGAGTT ATCCAGCATA TGTGCTGCTT CAGCGATGTC 1080
CTGCACAACA CAACACAACA GACCAGGACA AAAGCGCAGG TTTGACTGAG GAGCGGCGCT 1140
GA 1142