EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11736 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:67531517-67533197 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr4:67532820-67532830GCAATAAAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr4:67533032-67533046AATATGTTAATTAA+6.32
POU3F3MA0788.1chr4:67533032-67533045AATATGTTAATTA+6.36
Sox11MA0869.1chr4:67533073-67533088AACACTGAAAGAGTT-6
Enhancer Sequence
GAACTGGTCA AATAAATGGG GTTTTAAATT TTCAGTGGAA AAAAACAAAT ATATTTTCTT 60
TACAAACAAA AAAAGTAGTA TTGACCTAAA ACTGAAAATA TATAATATAG AATTAGAACA 120
AGTAAAAATG ATCAGGTTTT TAGGTATGTG GTTAGATTCT AGAGCTACAT GGAGTAATCA 180
CATCAGTAAG ATGCAGGAGA AATGCAAAAG AATTTTGAAT GTAATGAGAT GTATTTCTGG 240
GCGTGAGTGG GGAGCAGATA GACTAGCTTT AAAAACTATT TATGTAACAA TGATCAGAGC 300
AATTTTAGAT TATGGTTGTG TGGCATACAA TTCAGCAGCA AAGTCACAAT TAGAAAAACT 360
TGAAAGAATA CAATCCCAAG CTCTTAGAAT TTGTTGCGGA GCATATCCTT CCTCTCCAGT 420
TCCAGCTTTG CAGGTGGAGA TGGGGGAAAT GCCAATTCAA CTAAGAAGGA AACAACTGAT 480
ATTGACATAC TGGGCAAGAA CAAAAGGCCA AGAGGTTAAT CATCCTGTAA AAACACTAAT 540
GGAGGTATGT TGGGAATATG GGAAAAAGAA AATTAATAGC TTTAACTGGA TTATTGAGGA 600
ATTAGTGCAG GAAATGAAAT TAAATGAATA TAATATTATA CCATCAATAG TTCTACCAAC 660
AACACCTTTA TGGATATTAC CACAACCAAA AATAGACCTC AAATTATTGA AAGACAGACA 720
GGAAAAAGGA CATGAGTTAA CAGAGGGATA TCTAACAAGA GAGTATATCG GGACAAAATA 780
TGATCAGTAT ACACACATTT TTACAGATGC ATCAAAAGAT CCGCAAAGTG GCCGGGTGGG 840
GATCGCATAT ATTATTCCAA GTTTAGATGT GTTAGAAGGG AAAAGAATAT CTAATCATTT 900
GTCAGTATTT ACAGGAGAGC TGCTAGCAAT TATGCTAGCA GTCAACAAAG TTTATGAAAT 960
GGATCTAAAC AAGTCGATAA TATGTTCTGA TTCAACTTCA GCGTTACTAT GCCTGGATAT 1020
TAAAAAATCG GAAACTAGAC AGGACATTAT AATAGAAATT CTTCAATTAT TACAAAATTT 1080
AGAACAGAAA AACAAAATAG TTGAGTTTGT ATGGGTACCA GCACATTCAG GAGTTGAGGG 1140
CAATGAAGCA GCAGATAGAG TAGCAAAAAC AGTAATGGCA AAAGAGAGGA TAGAAATGAA 1200
AATCAGGTAT AGTAGGGCTG AACTTAAATC AGTAATTAAA AAGGGAATAC ACAAAAAGTG 1260
GCAAATAAGT TGGGACAATG AACAAAAAGG CAGACATTTA TATGCAATAA AACCAAAGGT 1320
AGGACAGATT TTGAAGTCAT GGGGGAGCAG GAAGGAGGAT TGTATTCTTT CAAGAATAAG 1380
GAATAAGGAC ATACATGGCT GAACGCTACA TTACACATGA TAGGAAAACA TCCAACAGTG 1440
TTGTGTGATG GATGCGGAGA GAGAGAGACA GTAGAACATG TAATCATTAG TTGCAATAAA 1500
TACACAGAGG AAAGAAATAT GTTAATTAAT GACCTACAGA TAAATGATGA ACAAATAACA 1560
CTGAAAGAGT TTTTATATCA GGAAGGAAAG AAATGGTTGA TTCAATTCTT AAAAAGAACT 1620
CAGTTAATAC ATAGGATATA GAATGTCTAA ATATATTTAT TTAATTAACT TAATTATTAT 1680