EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11733 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:66927887-66929237 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:66928787-66928797GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:66928787-66928797GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr4:66929225-66929236ATTTTAATTAA+6.62
MITFMA0620.2chr4:66928783-66928801GAAGGTCACGTGACATAC+7.31
MITFMA0620.2chr4:66928783-66928801GAAGGTCACGTGACATAC-7.31
STAT3MA0144.2chr4:66928958-66928969CTTCTGGGAAG+6.14
USF1MA0093.2chr4:66928786-66928797GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr4:66928783-66928799GAAGGTCACGTGACAT+6.02
ZNF263MA0528.1chr4:66928026-66928047TCCTCTCCCGACTGCTCCTCC-6.15
Enhancer Sequence
TTTGTTTATA TACAATAATG TTCGTTGTTG TTGAGGGAAG AAGAAGACAG GGTTGGCGAT 60
TCAGGTAAGC AAATATCTTT ATTATTTTTA AATGCCACCA CACATGTATC AGTGTGTGTG 120
TGTGTGTGTG TGTGCTCTCT CCTCTCCCGA CTGCTCCTCC CGTTCTCCCT AAGAATGGAG 180
TCTCTCCGGC CCAATCACTA GAAAGACAGG TGTTATTTAT CATTTCTGAT TTACCCGCTG 240
ATTAGCCCCC GGGCTCCTAG CATGCTCTCC CCCCTTATTG GGTGTTCGAT CACGCTTACC 300
TCTCCACAAA TATAAATGAT GAAATCAGCT CATTTCCTGT GTTTTATACA TGACTTTAAG 360
ATGATCTTCT GAGCTCAAGT GTGTCTTCTT CCTCCTCACA GCAGACTTTA CAGCTTGATG 420
TGGTGTATTA TGAACAATGT CTTTACTCTG TACACTTCTA CAGATGATGT CGAGTCCTCG 480
AGTTGAGTGT GTGTTATGTA TTTGTGTTTT TTTGTGCTCT GTTTCTCTGT GTTTTTTTCC 540
CTCTCTCTCT CTCGCTCTGT TCTCCCGTAT CTGCTCTCAT GTATTCTCAG GTTCCGTTCA 600
TTGGTCCATT CAGCTGTCAG TCATTCCTCC CCGGTTACGC CTATCGTACA TCACATCCAC 660
TAAGCAAAGA CCACCCGTGT TAAAAGCGCG CGCCAGACCA CTTGCTCTCT CTTGCTTGCA 720
TTTTTCTCTT TCGCTGTTTT GTCGCTTGTT TGTATTTACC GCGTGCGTTT AGAAATTACC 780
CTGTCTAACT GTGTATTTTG TTGTTGCTCG TTCTGTGTGC ACGTTATCCG TCCGTTATTC 840
GTACATTGTT CTTAGTTTAT CGTTGTTTAC GAGGCTTGGA CGAAGCGGAC AGGTAAGAAG 900
GTCACGTGAC ATACATTTCG CAACACATAG GACTACTCTG CTGTCTAGTA CACTAGGTTA 960
GGGGCGAGCA CCACTCCTTG TACTTTTTGG ATAGATAGAT AGAGTAGATA GTTAGGACTC 1020
GGAAGATCTT TGCGTGTTAA TTATACTGTT TTTCAGTTAG TTAGCTAGAT GCTTCTGGGA 1080
AGTTAGATTT AGTTTGGGTT TTGTTCTTTT CATTTCTTTA GCGCCGCTTA GTCCCTTCTA 1140
CCAGCTCTCT TGTTTTTTTC CGTCTTTATT TGTCTCAGTG TTGTACATAT TGTAAATAGT 1200
ATATTTTTGC TTTACTTACT TTTTCTTTAT TTTTGATTAA TTCGTTGTTG TTGTTCACTT 1260
TGGGATTGTA AATAAAAGCA CACATTTTTT GGCATTACTT TGGTTGTCTT TCCACTCATT 1320
CACTGTTTAT AAAAATATAT TTTAATTAAA 1350