EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11722 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:65096492-65097430 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:65096515-65096526AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr4:65096516-65096529ATTTAATTAATTT-6.07
ONECUT1MA0679.1chr4:65096610-65096624ATAAAATCAATAAT+6.53
ONECUT2MA0756.1chr4:65096610-65096624ATAAAATCAATAAT+6.59
ONECUT3MA0757.1chr4:65096610-65096624ATAAAATCAATAAT+7.01
PHOX2AMA0713.1chr4:65096514-65096525TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr4:65096514-65096525TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr4:65096514-65096525TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr4:65096514-65096525TAATTTAATTA+6.62
ZNF384MA1125.1chr4:65096707-65096719TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
ATAACACTTC AAAAGTAGTT TATAATTTAA TTAATTTATT CCGGTGATTT TAAAGATTCA 60
GCTTTATTAC TCTAGTCTCT AAGATATCAC TCTAATATTA ATATTAGTAT TAATGGTAAT 120
AAAATCAATA ATGACTGGAG TAATAGTTTC ATTTAAAACT GCATACAATA ACAAAGCAGT 180
TATTTAAATA TTTTTAAATA AATATTTAAC TTTATTTTTT TTTTACATTT AATAAATGTT 240
ATTGGTGAAC AGAATAATTG ACTGTCAGAA AAACTGACCC CAAACTAGGA ACCGGTAATG 300
TAGATGAAGA GAACAAAAAG CCACAAACAC TGATAACACC ACTACACACA CAAAATTATA 360
ATAAAAGGTA AATTATTGGA GGTTTATGTT CTGTTTCTTT TAGATGCAAC TATTAAATAA 420
GAAATATGTA ACAAATTAAC ACAACTGTAC AGAGAAAACA GAATTCACCT CAAATACAAG 480
CAAGCAGCAC ACGACTCAGG AACAATTCTG GAGAATAAAA ACAAAAAAAG GTTATGAAAA 540
CATTGATCAA AACCAAAAAC ACACACACAC AAAACACATA TACTATATGG TAATCTTAAT 600
ATAAGATGCA AAAGCGATTA TGCCAGGAAC AGTTGTGGAG ATTTATATAT ATATATATAT 660
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATGTAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 720
GTGTGTGTAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATAAAT AAATACATAT ATATGTATTA 780
AAGGCTCTGA AAAAGATTAA ACGGGACTTC AGCGCTTGAC GGGGACTGCG GTCATGCCAT 840
CTGCGATTCA GAGAGAGACG GTCAAGCAAT CTCTGCTTTT AATTGCAGTG CGCGTCAACT 900
CGGTGTTTCG CGGTAGATTA AAGACGCGTG TGTTTAAT 938