EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11721 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:65077221-65078573 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr4:65078412-65078424TGTGACGTCACC+6.44
CREB1MA0018.3chr4:65078412-65078424TGTGACGTCACC-6.44
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr4:65078412-65078424TGTGACGTCACC-6.32
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr4:65078412-65078424TGTGACGTCACC+6.62
FOXB1MA0845.1chr4:65078328-65078339ATATTTACATT-6.32
Foxq1MA0040.1chr4:65077805-65077816AATAAACAATG-6.02
LEF1MA0768.1chr4:65077663-65077678TTCCCTTAGATCTTT-6.02
MEOX2MA0706.1chr4:65078184-65078194AGTAATTAAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr4:65077789-65077802TTTAAGTGTTTTA-6.33
Enhancer Sequence
TCTTCTTCTT ATAATTTTAC GGCGGTTGGC ATCCAGCGTT TTGGTGCATT ACCGCCACCT 60
TCAGCTCCGG AGTGTGGACC AGAGGTTAGG TTTACAGACT AATCATTCCC CCCACTTCCC 120
TCTTTCCCAC CCCTTCTCAT ACACACACAT ACATACTTAC ATACACACCT CTCCCCTACT 180
CCCATGTTAT AATAATATCC ATAATACTCT CATACTACTA TTTACACTAA TACCATAATA 240
ATAATAACCA CCACATTGCT CTTACCCCTA CTTTTACTTC CACTACTTGG TTATATTTAA 300
CTTTATTCCC TTTACCTTAT AACTTAAATT ATTATATCCT ATCATAAACA CCTGTTTCTC 360
TCAGATACTT TATAAGTATT CTAGTCTGAA TCCTGTCTTT TGTATTTAGT AAACCTTTTA 420
ATGTTATTTC CTGAATCCCT ATTTCCCTTA GATCTTTTCT CATTTCCTCC CTCTGCTTTT 480
CATATCTTTT GCATTTTAGT ATCACATGTT CAACTGACTC TTCTTCACTA CATCCCTCAC 540
ATAATCAAGT TTCATGTTTT TGTATCAATT TAAGTGTTTT ATTTAATAAA CAATGACCCA 600
ATCTTAATCT TGTTATCACT ATTTCGTCTC GCCTATTACC TCTACTGACT CTTTTGTGTT 660
TAACAGCCTT TTGAACTGCA TACAAATGCC TTCCTTTCTT TTCTCTGTCC CACTTCTCTT 720
GCCACTTTTT ATTTATTCTT ACCCATATTA GACTTTTCAC TTCTGCTTTA CTAACCCTTA 780
TTTGCATTTC TACAGTTTCT TTTGTTTTTG CCACTTACTC TTAGTCATGA CTTATTATAT 840
ATAGGTTTTC TCTGCGTTTG GACACTTTAC CCAGTAAAAA ATTAACAAAG CAATACAAAT 900
GACCTGTTTA AAATGAATAA AACAGTGAAT GAACAGAAAC AAAATAACTT CTCTTTATAT 960
GAGAGTAATT AACAAAAATA AATTCGGTAA GTCAGAGCAA GAAACAATAG CCACAAATGA 1020
GCTAATTAAA ACTAGTACTC CATTTCTTAT ACATACTTAG AATAAAGTGA AATCATCCTA 1080
TTTAATAAAT TAAACCTTTG TCTTAAAATA TTTACATTAA AGGTTTGTCA TGACTGCAAC 1140
AGTAAATGGA AAAAAAAGCT AACCAAGAAA TACTTTTATT TTGACGCGGC GTGTGACGTC 1200
ACCAGACGGC GCCGCTTCAG CGCTGTGATT CAACTGGAGA AAGGTTTGTT TTAAAACGTT 1260
TACAGATATA AGCCTATTTA AAGTTAAAGT TCTAAAGTTT TAGTTTTTTT ATACGATGTT 1320
AAATTATGTT CCTGCTGTTG GACATATTAT TT 1352