EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11687 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:56927510-56928476 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:56927721-56927732ATATTAATTAA+6.62
Arid3bMA0601.1chr4:56927721-56927732ATATTAATTAA+6.62
FOXB1MA0845.1chr4:56927542-56927553ATATTTACATA-6.62
FOXB1MA0845.1chr4:56927542-56927553ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr4:56927542-56927553ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr4:56927542-56927553ATATTTACATA-6.62
Lhx3MA0135.1chr4:56927620-56927633AAATTAATTAATA+6.37
POU6F1MA0628.1chr4:56927622-56927632ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:56927622-56927632ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TATAAGAACA TTTAACAAAT AGAAAATTAA GTATATTTAC ATATGATAAA AATGATTGAG 60
AATTAGAAAA AATAAGTTGT TAAACAGTAA ACTAAAATAG ATAAATAAAT AAATTAATTA 120
ATAAAAAAAT GGATAAAAGG AGTCTTTATT TGATGAAGGA AAAAGTGGGG GAAAAAAAAA 180
AATTTATTAA GTCATGAGCT AAATTCTATA TATATTAATT AAGAGGACAT ATGGATGAAC 240
TTTGGGGGAC TGTAGTCTCG TACCTACCAG ACATCTGAGT ATACTGGCAA ATGGAAAGGT 300
GTGTGAAAAA ACACAAAGAG CAAAATGGCT GTGGACACTT GTGACATGCT ACAGCAGTGA 360
TGCAGGCACT GCATACTCAG GATTTACTGA GGACTGAAAA AGCTACATTT GTTCAGAGAC 420
ATTCAAAAGA GACACTAACA AGAGACTGAT GAACTGATCA AAGAAAAAAC GCTCCACCAG 480
AACTTTACAT CAGCTGAGTC AAAGAAAGAA GCCAGCCCAA AGAGAGAGGG GGAAACACTG 540
AAAAGAAAAG ACACCAATCT GGAGCTAGTT GTCTCAGGTT GCGAGGGGGG ATAGTCTGAC 600
AGTCCATCTC AAAGTAGCTC CTAAAGTCCA AATTACGTTC AAGCATTACA GAAGGAAAAT 660
TAAGAACAAA AGTGTAGCTA CCCATTCTTG TATCAAATCA GACTCCTGTC AATTTGAGAG 720
AAATTATTAT CATGCAAATT TTTAAGTAAG AAAAAGTGTT ATAAGGTCAT TTCAATGTGA 780
AACTTTAAAT ATTGAATGAT ATATTATGTT GAATGTTAAA TAATTTAGGT TTAAGTTTTA 840
ATAGGTTTAA TCATAAAAGT CCTTAAACAT AGAAGGATAA ATTACAATGC AGGGTGGTAT 900
CTAAAGAAAA AGAGAAAAAG CTTTTGATAA GGCTATACAT AATTTGGAGA ATAAATAAGG 960
AAGGAA 966