EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11655 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:49627729-49628597 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:49628093-49628105GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:49628097-49628109GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:49628101-49628113GTTTGTTTGTTT+6.32
Hmx1MA0896.1chr4:49628546-49628563TTTCCTTAATTGCTGTT-6.27
TWIST1MA1123.1chr4:49628482-49628495CCACATCTGGATT-6.33
ZBTB18MA0698.1chr4:49628482-49628495CCACATCTGGATT-6.52
ZNF384MA1125.1chr4:49628122-49628134TTTTTTTTTAAC-6.04
ZNF384MA1125.1chr4:49628121-49628133TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
CTCTGCCATC ACCCAGCGAT GCCTGTGGAG GTCTGCTGAA AGTCTGAGGA AGGTTGACAG 60
GGCGCGGCGC TTTGTCAACC ATGCGATGGC TACTATTATG GTGTCAGTTG GTGGTGCCAT 120
TGTTCATCAC CCAGAGATAA CATATAAAGA TCCTGGCCAT TTCTTACATG ATAGAGTTCA 180
TTTGACCCCT TTGGGCAATG ACATATTTTT AAAAAACCTT GCCCAGTGTC TGAAAAATCA 240
AATCCAGTAG GGTGATGCTG GATTTGGAGT TTCCACAAAG TTTTGGGATG AAAAATGGCC 300
AAGATTTTTT TGTTTTTTTG ATATGTGATG AACAATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTTC 360
TTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGTTGGG TGTTTTTTTT TTAACTAGCC ATCGCACTTC 420
AGAAAGATCT GTCACAACTT TTTCTCCCTC TTGTACCTTT TCTACTTCTC TTCTCCAGAC 480
CCTATGCTTC CTCAGCCAAT CCACCTGATA AACTTCCTAA ACGTAACACT TTACACTACA 540
GGGCACATAA TTAATGTTAA TTAATGTATT TACGAACATT AACTAATTTA TGTATCATTA 600
ATTCATTGTT TGGTCAAGTT AGAAAAAACA TTAACTAACA TTAACTATGT GTCCCATATT 660
TTAAAGTGTT ACGTTTATTT TTCCCCACGG TGAATGTAGC TGTTATGATC ACCAGCTGGG 720
GTGTGCACAA CTTCTACTAA ATGGCACTCT ATTCCACATC TGGATTACAT TTCCCATAAA 780
GCTTTGCACC TCTACAGATG ACACTTTATC AGGACAATTT CCTTAATTGC TGTTTCACCT 840
TTTTCTCTTT TGTGGACTAT TTAAGACT 868