EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11653 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:49317194-49317832 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU4F3MA0791.1chr4:49317355-49317371ATCATGAATAATTCAA+6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr4:49317317-49317334AGGTCACCGTAAGCTCA-6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr4:49317317-49317334AGGTCACCGTAAGCTCA-6.56
Enhancer Sequence
ATGATGAACG ACATTAAACA GCAGCAAAAC TCTGTTGCTT TGTATTTTGC TGCTTTCGGT 60
TTGTATTTCT TAACGCACTT CCGTGTGCGT TACTCCACCG TCATGATCTT GGATGATGAG 120
GTAAGGTCAC CGTAAGCTCA GCGTAGTGCT TCGGTCACTG AATCATGAAT AATTCAAGTA 180
AAACGTAGCT GTGTTGTCAC GATGATTGTG TCTGTCGTAA CAGCTCGTAA TACTTCTCGT 240
GAATATTAAT GTGGTGATGC GAGCTATCGT TTCGTTACAC AATGGCTACG TTGAGCCTAC 300
GTCATCTGCT CCACTTCCTT TAAAGAAGCT CAACATATTT GGCAGCGAGA AATAAACTTA 360
CAAACCGTCC TTTTTAACAC GAGCTCTGTT AAACCGTCAT GAAATGTCCG CTATCCATAC 420
TGTTCTCTCA TCATAACTTT TTAGCTCTGA AAAAACGATT TCTTGTCAAA ATAAAAGTCC 480
CCCATAAACA ATAGAAATAA AGTGATCCTT AAACATGAAG AAATGTAAGA TAACTCTTAT 540
TAACGTCTGT TACAGTGTTA ATTAATAAAT TAGTTAACAC CTTAGTGCTT ACAAGAACCA 600
TTAATGAACA AATGTAACAT TAGATAATGC TGAGTGTA 638