EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11638 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:45801396-45803224 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx1MA0896.1chr4:45802033-45802050AGAAGCAATTAAGGAGA+6.52
Hmx3MA0898.1chr4:45802033-45802050AGAAGCAATTAAGGAGA+6.06
Lhx3MA0135.1chr4:45801755-45801768AAATTAATTATCA+6.12
PBX2MA1113.1chr4:45802517-45802529ATGATTGACAGC+6.44
Enhancer Sequence
GAAAAGGTTG GTAACAGAAA ATTTTTTATG CGTAAAGAAG AAATTGAAAC ATGAAAAATT 60
GAACTCAAGT CATCGGGTAA AAATTAATAG TTCTAATCTG ATAAAAGAAT TGAAACATAA 120
TAAGAGAGTT TAAGAAAACA GATTTTCTTT CACATGTAAC CATGTGAAGA AGTTTAATGA 180
TGAAGTCAAA ATACAGCTGA AAGAAACGGA TGAGAAAATG TAGTGATTTT TAGTTAGCTT 240
ATAAAAGTAT ATAAAAAGTG TATGGGCAAC TAGTTGAACC GAAATGACGT AGAACTAATT 300
AGTAGCCAAA AGAAAATCAT AAAAATGATT AGAACAAACT AAGTAATAAA TAGTTAAGAA 360
AATTAATTAT CAAAAGTAGT GTCAAATTCA AAAACTGATT GATTATTAGT GAAATACTTA 420
AATGGAGGAT TATAAAATTA GCCAGCGTAG TGAAGAGGTA GTATGTTGTT GAGCAATTAA 480
GAGAAATACC TAGACAAGGT CATCTGGATT ATGTTTTAGA CATTTTATTT AAGCTAAATT 540
TTAACTGAGT TATAAACATA GATGTGACTA ACTTAATTTG AATACAATTT TACAAGTAAG 600
CAACAAACAA AAGAAGATTG TGTTTAGTTT ATGATTTAGA AGCAATTAAG GAGAAGAGAT 660
TTTAAAGCTG AGGTTAATAG TGTATGCAGA AATATGGTCA TACTGATGAA AAAATGTAAA 720
GTGATTGATT TTTGAATTAT CAGAGAGAGT GGTGTTTATT TAGCATGTTG ATGAAATTTT 780
ACTTGCAGAA AAAAGTGGAC AACTAATAGA TTAGAAGTAA GCAGTTGTTA TAAAATTTAT 840
ATGGAACTAG ATTTAAAGGA AGTAAATAAA AATTATAGGT GATTAGATGA CACGCCTCAA 900
TATTAGGATG AGTGCTGTCT GAGAAAAGTG GAGTCAGATT GCTAAATAAA TAAGCCATTT 960
TTAATAGCCG TATACTGGTG ACTGTAAAAG ACATGGTAAT AAGACTTAAA TTATATTTAG 1020
AGGTATCAGA AACTGCAAGA GAAGAATGAG GGTGAGGTTA CAATTGATTA TAGAGATATG 1080
GGAGAACAGG CGAATAAAAT ATATATATAT ATCTGCTAGT CATGATTGAC AGCTATACTG 1140
GATGGCTGGA GGAGTGGCCA GCAAGCAAAG AGGACAGTCA GACAGTAATG AAGTGTTTAA 1200
TGAAAGACGA TCTAGAAACA AATAGATGTT GAGTAAGAAT TAGAGTGGAT AATAATAAAC 1260
GCTGAAATAA TGAATATTTG AAATTGCAGC AAGTAATGGG CCTGAAGCAT GAATTTAGGG 1320
AGGGTGTAAA ACTAATAATT ACAGGGAAAG GTAGAGAAAA TTGATACAAA TTTAAAAACA 1380
ATTGGCAAAA ATCTGTGCAC AGACCAAACT GAATTGGATA AAAATCATAT TGGAGGTATT 1440
AGATCATTAT GGAACAAAAC GATGGAATTA ATGACTCTTG AATTGTTTAC AGGACTGCAG 1500
TTTTAGGGAC CTGGTGCAGC TTGGATGTGC AGTAGCTTAC TTATGTAGAG ATTATATAAT 1560
GACAAATTAA CAACCTTATT CCCGATTTTT TCTAAACAGG TTGCTGAAGG TGTGAGGCTG 1620
GCCGGATTAA CTTGACAGTC AACATAGGGG TGTAAAAACG GCCTGGAGCT AGGCCCAGGC 1680
CGAAAGAGGA ATAAAACAGA AAAAGGGGAT ATCTGATATC TAATTGGAGT GTGTAAGCAT 1740
GTATTGGTGT GGGAGCTGAA CACGCTGCAA CAACAAGGCC AACTGTAAAT TAGATACAGG 1800
CCAACACAAA AAGGGGAACC AAAAACCA 1828