EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11635 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:45225913-45227417 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:45227205-45227224TGACCAGAAGAGGGCGCGC+6.42
HOXD13MA0909.2chr4:45226655-45226666CCCAATAAACC+6.02
KLF13MA0657.1chr4:45226448-45226466CAGAAACGCCCACTTTTG+6.03
Enhancer Sequence
TAGTCCAGTG TTAGCAATGT GTGTCGGTGT GTATGAGTAA AGTCCAGTTA AACACTTAAC 60
TGTCCTCATA TACCAGTGTT AGTAATGTGT GTCTGTGTGT ATGAGTAATG TCCAGTTAAA 120
CACTAACTGT CCTCATAGTC CAGTGTTAGT AATGTGTGTT GGTGTGTATG AGTAAAGTCC 180
AGTTAAACAC TAACTGTCCT CATAGTCCAG TGTTAGTAAT GTGTGTCTGT GTGTATGAGT 240
AAAGTCCAGT TAAACACTTA ACTGTCCTCA TATACCAGTG TTAGTAATGT GTGTCTGTGT 300
GTATGAGTAA TGTCCAGTTA AACACTAACT GTCCTCATAT ACCAGTGTTA GTAATGTGTG 360
TCTGTGTGTA TGAGTAAAGT CCAGTTAAAC ACTAACTGTC CTCATAGTCC AGTGTTAGTA 420
ATGTGTGTCT GTGTGTATGA GTAAAGTCCA GTTAAACACG GAATGTCCTC ATAATGCAGG 480
ATTGTTGCTG TGTGTTTGTA ACACTCATGG CTGTCCTCAT AATGCACGAT TGAGTCAGAA 540
ACGCCCACTT TTGCCCTGTC CCCACAACGT TGTAGAATGT CAGGTCTTAA TATTTCCAGA 600
CTCTTTCACA ATAATGAAAT TCTGAATAGA CAGAGTTATT CCCCATGCAA TATGGAGAAG 660
ATTCATATAT TTTACTAAAC TGTAAGACAA AAGGAAAGGT GGGTCCCCAT ATCCCATGAT 720
GGTACTTTTT TAGGAAAAAA GTCCCAATAA ACCACCCGTA CCAGTATGTG TGTGTGTGTG 780
TGTGTGTGTG TGTGAAAGTG TGTAGCTGTG TGTGAGTATG TGCTTGTGTG TGAGAGAGAG 840
AGCTTATGTG AGATTGTGTG TGTTTATGTG AGAGCGAGTG TGTGTGTTTG TGTGTGAGAG 900
AGTGTTTAGG TGTGTGTGTG TGTGTGAGAG AGAGAGTGTG AGTGTGTGTG TTAGAAGAGA 960
GAGAGCTTAT GTGACATTGT GTGTGTGAGA GATTGTGTGT GTGTATGTGA GAGCGAGTGT 1020
GTGGTGTGTG TGTGTGTTCA TGTGAGAGTG TGTTGTGTGT GTGTGCATGT GTGAGTGTGT 1080
TTGAGAGAGA GAGAGTGTGT GTGTGAGAGA GAAAATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1140
GAGTGTTGTG TGAGTACATG TGTATTGTAA TGAATGGTGC CATTATTAAC GTGAGATGAC 1200
GAAAATACAA ACTCAAACCT CTCCTGTACT CTGACAATAC TTCAGAGCTC CACTTTATCT 1260
AAATCAGTCA AGTGTAGGAG AAGAGCACGA CGTGACCAGA AGAGGGCGCG CAAGACCAAT 1320
GAACAGAGAG GGAGAGAGAA GTTACTTATC TATCTCTGAC CCTCATCTGC TCTTACCTTC 1380
CCCTGACCTC CTGTCCTCTG AGTGCATACG GCTAGCGCAG CTGACCCTGA AGGCCTGAGA 1440
CTCTCTGGTC ATGGAAGCAG GGAAGTCTCA TAGCCTCCAT AGGCACGGAT ACCTCGGGTT 1500
GGGG 1504