EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11617 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:43253997-43255111 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:43254634-43254655AAAAGGAAAATGAAAGGCACT-6.33
IRF1MA0050.2chr4:43255065-43255086ACATAGAAACTGAAAGAAAAG-6.75
SOX4MA0867.2chr4:43254358-43254368GAACAAAGGG+6.02
ZNF263MA0528.1chr4:43254466-43254487GAAGGAGGAGGGAATGGTAAG+6.16
Enhancer Sequence
AGATACTGTG AAATCGCTAC CATACTCAAC AAAGTTTGAG ACGCTGACAG GAACAGAACA 60
TTTTAGGGTC ATACATGACA GACAGGTGAA AGTCTGCAGA GTCTGTATCC AACCAGGACA 120
CATTGTAAGA GACTGCCCTA ACTTTAAGTG TTATAAATGT GGCATTCAGG GTCATTATGT 180
GCGCGAATGT GACAAAGGAA AATGCAAGTT GTGTAAGATG GTCACTGCAA TGTGTGTATG 240
CAGAATTCCA GAGGAAGAAA TCATGGGAAG CTCTCTGGAT CTATATGAAA GTGTGGAGGA 300
GGCAATAACA GGAAAGGAAA AAGATGAAGA AGATAAACAG AATGAAGAAG ATATAATGGT 360
AGAACAAAGG GCTGGAGAAG AAGTACAAGA GCCGATGGAT GACTCACAAG ATGCCATGGG 420
AAAATTCCCG CAGAAGCAAG TGTTTCAAGA GGAAGAGGAA TTATTAATTG AAGGAGGAGG 480
GAATGGTAAG AAAGGAGGTC AAGAAAAAGC GAACCAAGAT GGGAAGGAGC ACAAGGAAAA 540
TCAAAGGGGA AGAGACTTCA TGACGAGAAT TTTAGAGACA CCACTGATAC AACTGGAGGA 600
GGAAATGGAC ATGAGTGCCG GAAATATCAA GATGCTGAAA AGGAAAATGA AAGGCACTGA 660
AGAAGAGACT ACAAAAAAGT AAGATCTGAA GACATTTTCA AATGTGGGTT CTCCTCTTTT 720
TTATACTATA TGCAATGTGT GACTTGCTGA AAATTGCCTG TTTGAACTGC AATGGACTAA 780
GAGAAATGGA AAAGTTTGAG AGGGTGATTA GAAAGTTCAA AACAGATGTA ATTTGTTTGC 840
AAGAAACACA TTGGTCAAAT GATAAAATGA GTGATATAAA AAAAGTTTGG GGAGAAGAGA 900
TTTATGTAAA TCATGGAAGT CAGAGAGCAT GCGGTGTGGC AATTTTGCTT AAAAAGGGAG 960
GAGTACATAA TGTAAAGCAA ATACATAACG ATGGTAATGG TAGATTGTTG GGAATAGACT 1020
TCATGTATTA CAATGAATCC TTTAGATTGC TTAATTTATA TGCTCCTAAC ATAGAAACTG 1080
AAAGAAAAGA GGTTTTTAAA ACAATGAAAC CACT 1114