EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11599 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:39904640-39905935 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:39904814-39904833GGGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.64
CTCFLMA1102.1chr4:39904815-39904829GGCGCCCCCTGCTG-7.31
YY1MA0095.2chr4:39904644-39904656GCAGCCATTTTG-6.52
Enhancer Sequence
GACGGCAGCC ATTTTGCGCC AGCCCACACA TGATGAAGCC AATTGAATAT GGCCATGATG 60
GACAGAGACC CCTATTCTTT TTTTACATTT TTAACAACCA CACGTTAACA TCCTCAGACG 120
GTGCTCACTG AGCAGTATAG CGTCCCCGTC ACTCAAACAC ACAGACCAAA GGTTGGGCGC 180
CCCCTGCTGG CCTCACTAAC ACTAATTCCA GCAGCAACCT ATCTTTCCCA TGTGATCTCC 240
CATTCAGGTA CTGACCGGGA ACAGCCCTGT TTAGCTTCAG TGGGCGGCCA TGTGAGAGTT 300
GCAGAGAGCT AGCTGCCGGC TGGTAATGGA GTTAATGTGA TTGTCTGTTG TGGTGAAGGA 360
GCTGAGACGA AAGGTAATCT AAGTACCTAC TGTCACCCAT GGTCATGACT GAAAGGACAA 420
AATCTCGGAT ACAACCAGAC ACATTTTACA AAGTGTTATG ACCCGCTTGT TTGAGTCGCA 480
GCACAAAAGA AAGATGAGCC AACAAAATAA CCTGAATGCA AATGATTTAT TATAAAATGT 540
AACTCATACA ACAATCAATC AATGCAACCA ACAAATGTCT AGGGATACTA ATGAAGATAA 600
AGAACTTAGG ATATAATCAC AACAACACGT TAACTACATG ATATAAGTTA TGCAAAACAA 660
AACCATAAGG TTAAATAATC AATGAGATGG GAGGTCTTGA CATGAGGACT CCTGAGTAGC 720
TAACACAACA ACTTTTATAT ATCCATTGAT GAGCAATGCA GGCATCCAGT CACGATTTAC 780
CACATACTCC AACCTGGATT TCTCATTCAG GGAATCAGAC AGATAACATC ATCCAACACA 840
ACGCTACCTA CATGAACACA CTGGAGAGTG GATAACAGAT GAGATTTCAA GCCGCAGAGG 900
TGCTGTTTGC CAGATGTTTA TGAAACTGTT CTTCTCTCAG CTGCCATCAT TGTGTTTACA 960
TAAATGCGAG GAGCGCGACA CATTTACAAC CCCACCTACT GCAGTGTAGG AAAACAGTAT 1020
ACCGTTACTC AGCCTTTTCA AACATTATTC AGACATGAAA CATCCTGTGA GAAAATGTTT 1080
TGCTGCATTC ATGTCATGTG TGCAACTTTT TGTCCATGTG TTTTTTAAGC TGCTGCGAAT 1140
GAGCGAAACT CTGTAGACAC TGATCAGATC TGTACGTTTC TCTCCAGTGT GAATCCTCTT 1200
TTGTGTTTTC AGATGTGTTA ACTGATTAAA CCTCTTGTCA CAGTTTGAAC AATTGTACGG 1260
TCTCTCCAGT GTGAATCGCT TGGTGCAGTT TTTGG 1295