EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11564 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:31881464-31882518 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:31881784-31881803TGGCCAGCTGGTGGCGCTA+6.84
CTCFMA0139.1chr4:31881479-31881498CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
Hmx3MA0898.1chr4:31882351-31882368AGCAGCACTTAATTAAT+6.19
IKZF1MA1508.1chr4:31881599-31881611ACTTCCTGTTCC-6.44
Enhancer Sequence
GAGCCAAACT ACCTTCTGCC AGCAGGTGGC GCTATGACTG ACTCAATATT GTTATATGGA 60
TGTGTTCAGG AGAGGAATTT TATCAACCAT GTGAAGTTTC AGGCAGATCG GACATTGTGT 120
GGTTGAGTTA TAAGGACTTC CTGTTCCATG GCGAAGCGTT GAGGTTTGTC ATGCCGCCAC 180
GGACACACCC CTCTGCAAAA ACTCTAGATC TTCACAATAT ATCATCGCTA GAGCTTTCAG 240
ATGACAACAC CCAATTTTGG TGCTGATACA ATAAAATTTG GTGAAGTAGT ATGTTACAAT 300
GTAAAACATG TCATTTCCTG TGGCCAGCTG GTGGCGCTAT AACTGTGACT CAAGATTGTT 360
ATGTAGATGC CTTCAGTAGA TAAATTTTAT CAACCATGTA AATTATCAGG CAGATCGGAT 420
ATTAGAGTTA GTGCAGGCCA TCACCACATT TTTACTGCTG TTACTGTACA TCAATCAGTA 480
ATTAGACGTG ACTAATTAAA ATTTGTACAA ATTCTGCATC TGGACAATCA CTATACCCAG 540
CATCAACAGC ACCACTTTTA TCTTTAGCAT CAGCCGCACT ATCACCAGCA TCATTAGCAC 600
CTGAACCATC ACCAGTATTA GCACCATCAG AAACATCAGC TGCTCCAACA CCATCCCCAG 660
CAGCACCGGA ACCATTACAA GCATTAGCAG CACTACAATC CTCAGCATCA ACAGCACCAC 720
CATTCCCAGC ATCAGTACCA CCACCATCCC AATCCCCAAC ATCAGCATCA GCAGCACTAG 780
AACCAACCAC AGAACCAACC CCAACACCAG GAATCTGCGT ATGTAGAGAG AATGTTTATG 840
TAATGCTTGA ATTGTTAATG GATTTACCTT TGTTTAGGGT GTTTATGAGC AGCACTTAAT 900
TAATTACATT ATTGTTGGAA CTTCTATATT GCAAACAGGA CTGAGCAGTG ATGAAAATTA 960
TTTTCCTGGC CTGTAACTGG GTGGAGAACC AACACCACTT TCCTGTGAAG ATTCAACTGC 1020
CAAAGATCTT AAGGATGAAG GAGGAATATG CCTT 1054