EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11551 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:29666457-29667245 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr4:29667153-29667167CAAAGGTAAACAAC+6.65
HNF1AMA0046.2chr4:29667168-29667183TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr4:29667169-29667182GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr4:29667171-29667184AAATAATTAATTC-6.22
POU4F1MA0790.1chr4:29667169-29667183GTAAATAATTAATT+6.11
Enhancer Sequence
TGCAGACAGG TTGAAGACAG TGGATAAGTT GGCATCATGT TTTGGACCAG AAAGAGCTGT 60
GAAGATCACC GTGGACATCC TGAGGACAAT AAAGCAGAAT CAATTGGCTG AAGAGCTGGA 120
GAATACACAG AAGCAAGGTA TTGTTTAATG TCCTGTCAAA ATTTACAAAT GTGATCATTT 180
GACTCATGTT TTTATGTTCA CATTTTACAT GTTAAAACCC TGTCCTAGCA ATGGTTTTTG 240
AGTCAGATGT ATTGTCATAA CATGTTGTAA TGGTGGCTCT ACATTAAGCC CCAAGTAAGT 300
AATATTTTAG TATTTGTTTG GGTGCCAGGC ATAATAAAAC AATATTACAA ATTTAACTTT 360
AGCCCAGATA GCTATAAGCG ACCGACTACA ACTATACAAA ACATAAAAAA ACAAAATACA 420
CATAAAATAT ACACAAATTC ATGTATTGAA ATAATTATAT TTTCCATCAC TGAAATATCA 480
CCACCAACAA ATCGCTTACA ACCAAAATTG AACATAAAAA GTTTTATGAC AATATCATGA 540
TCAATTTATA CCACACTCAA AGAAAAATGT ATCCACTGCA ATAATAATAA TAATCAGTAT 600
CTACTACATA AAAGACATCA GGGAGCATTT CATCAATATA CAAAAACAAA CCCCAAGAAA 660
GTTACACCCC TCACAATCAT TGACTCTCTG GCCATTCAAA GGTAAACAAC ATGTAAATAA 720
TTAATTCATG GAAACAGTTC AGTCGCATCA GAGTTCAGTT ATCTCTCAAT TAACAACCAC 780
TCTGGAGG 788