EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11529 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:27867849-27868608 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:27868533-27868545GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868537-27868549GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868541-27868553GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868545-27868557GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868549-27868561GTTTGTTTGTTT+6.32
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Foxd3MA0041.1chr4:27868561-27868573GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868565-27868577GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868569-27868581GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868573-27868585GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868577-27868589GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:27868581-27868593GTTTGTTTGTTT+6.32
POU1F1MA0784.1chr4:27868251-27868265GTAATTAGCATATA-6.2
POU3F1MA0786.1chr4:27868252-27868264TAATTAGCATAT-6.44
POU3F2MA0787.1chr4:27868252-27868264TAATTAGCATAT-6.62
POU3F3MA0788.1chr4:27868252-27868265TAATTAGCATATA-6.67
ZNF384MA1125.1chr4:27867996-27868008TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr4:27868077-27868089TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr4:27868076-27868088TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
ACGAAAACCG GCAAGTCTCC TATAGATTAC AATGGCTTTT TTCAAAGCCT GTACATCTTT 60
GTGTTGTCTA GTGGTCTATT GTGTGCTTCA CACATTGAAC GCGGTACCCT GAATAGACGA 120
ACGCTGGCAG TATGTGCTCT ATAATTCTTA AAAAAAAAAT GCTACAGCTA GCCCGAATGG 180
ATAGTCACTT CATAAAGGCT TTCAATGGCT CATCATGTGA GAGTTTATTT AAAAAAAAAA 240
GAGAGAGAGA AAGACGGACA GACTGAGGCA GAGAAATGAA TGACACACTC CATTCTCCTG 300
GGAACATGAG AGCTGTCAGT CATACACAGT GCTTAACATT AAGAGTAAAA TGTAAAATTT 360
GTGGGTCAGA ACGCAGTTTT CACTTGACAT TTGAAAACTG CAGTAATTAG CATATAACAT 420
ATTCTACCAC CAAAAAAGAA GAATATATGC ACAATATATT TTGCATATAC AAAATATACG 480
TTGAATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 540
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 600
ATCTAACTAT CTATCTATCT ACCCATCCGT TAATTTATTC ACTTATTCAT TCAACCATCC 660
ATTCACATAC TTATTTATTT ACTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT 720
GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTATGTAT TTATGTATT 759