EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11459 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:20544641-20546832 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:20546382-20546399TTGTTTGTTTACTGTTT-6.49
HNF4GMA0484.1chr4:20544764-20544779AGGGGTCAAAGTTCA+7.51
Hnf4aMA0114.3chr4:20544765-20544781GGGGTCAAAGTTCAGA+7.53
NR2C2MA0504.1chr4:20544945-20544960TGACCTTTGACCTAT-6.74
NR2C2MA0504.1chr4:20544764-20544779AGGGGTCAAAGTTCA+6.99
NR2F2MA1111.1chr4:20544943-20544954TATGACCTTTG-6.02
Nr2f6MA0677.1chr4:20544765-20544779GGGGTCAAAGTTCA+6.68
Nr2f6MA0677.1chr4:20544945-20544959TGACCTTTGACCTA-7.64
RXRBMA0855.1chr4:20544945-20544959TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRBMA0855.1chr4:20544765-20544779GGGGTCAAAGTTCA+7.58
RXRGMA0856.1chr4:20544945-20544959TGACCTTTGACCTA-7.25
RXRGMA0856.1chr4:20544765-20544779GGGGTCAAAGTTCA+7.58
RxraMA0512.2chr4:20544945-20544959TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr4:20544765-20544779GGGGTCAAAGTTCA+7.52
Enhancer Sequence
CCTCTCTGAT GGCAAAATAC CAGCGAGAGC TAAAGAAGAG GCAGCCTTTG ATGGGTGACG 60
CAGAGGCCGA AACCGACCCA GAGGAAAAAC AGATCTCATC AGTTGCATAG GGGAACGGGG 120
GAGAGGGGTC AAAGTTCAGA GGGATGCTAC AAATATAAAG AATCCTTTAC TGATTGAGCT 180
GCACATTTGA TGATCACTTG CCCAGCGGAG GATTCATCAT CCTTGTGTCC TGTTTCTCTG 240
TCCTTCCTGA GACCCTCTCT GACTCTCAGA CTTACTCTTT ACTCAATCTC TAAACTTTGG 300
CTTATGACCT TTGACCTATT TGCCCCAGGA CAAGAGGGAC CACTCAGCAC TTTAAACTCC 360
CCCACCCTCC CCCAATGTTG AGAGGATCTC AGCAGAGGAG GCGTGGATGC AACTGTTCAC 420
AGTTCTGAAC CCTGATGTTT CTAGAGGATC ATGTGCTGTC ATTAGCATTA GCCTCTGTAG 480
CAGCATAACC ATAAACCAAA CATCCTATCA TAACCCTAAC CCCAAAACCT TTACCTCTAA 540
TCCCAACCTT TCAATACTAA TCAAAACCAC CAATCTAACT GTCACCCTTA AATACTAATA 600
CCAATCCTTA CTATATAGGC TCATCTGACC ATTGAGGTAA CACTGTGTCT ACACCGGGTC 660
CACACCACAT CAAAAACCAA TAACACTCAT TATAATCAAT GTTGCTTCTC GATGCATCAT 720
ACTGAGTCAC AGACCGTAAA CAGACGTCCT AATTTCTGGT GTACTGTATG TGCTTGTTCT 780
ACTTCTGACA AAAGGACAAA TTGATTTGTA ATGTTAATTT TGTCTAGTTT ACATAGCCTC 840
ATGCAGTTTC TGCATCTCCT GTCAATAGAC ATGCTCGGTG TAAACACTGT GTAATCCTAA 900
ACCTCCAGCT CTTGTTTTAA ACCTTTACCC ATCAACCACC AATTTTAATT CCAGTCATAC 960
TATATTAATC CACCACTAAT CTGAACCCCA ACTCTAAACC TCCAACACTA ATCCTTCCAA 1020
TACCCTAACA CTCCATCACT AATCTAACGC TCAACCTTAA TTCAACACTA ATTCCTCCAT 1080
TAACCCCAAT CCTTAACTGC AAACAACAAC CCCTCCATTA CCCTAACAAT CCATAACTAA 1140
TCTAACCCCA ACCTTTACAC CTTGAACTAG TCCCTCCATT ACCCCAACGC TCCATCAGTA 1200
ATCTGAACCT CCAACCTTTA ACCCCAAACA CTATTGCCCT AACACTTCAT CATAAATCTA 1260
AACCCAACCC TTAACCCCCA ACACTAATAT TTCCCTTACC CTAAAACTAC ATCAATACCA 1320
TACCATAACA CTCCATGATT AATCTGAACC CCAGCCCTTT CCAAAACCCA CTCCAACCAT 1380
TTACCATAAA GTTTCATAAT TGATCTTTAC CATCAAACCC CAAATTTCCA ACACTAATCC 1440
CTACCCTTAC CATAACCCCC ATCACTAATC TGAACCCTCA ACCCTAAACC TCCCAACCCA 1500
AATATTAATT CCTTTACTAA ACTCTAACCA ACTCTCACCT CCAATCCTAA CTGTAACCCT 1560
TAACCTTATC CTAGTGTGCA ATGGACATCA TTTCCCCGCA TATCATATTT GGAAATATTC 1620
CCATCTTATT TATCAGCTAT AATATATTCT ATACAATGTG ACGTGACCCC AGATTTCTGT 1680
TCTTAAGTGT GAGGTTTGTC CTCTGTATTG TGTGATAATA ATTTGTGTTG ATAACATTGT 1740
TTTGTTTGTT TACTGTTTGC TGTTTCCCCA TGTTCATCTC TAGAGGTCAG ACGTGTTTTT 1800
GTAAGAATAG AAGAATCCAG CCCTGGTGTC TATCGTGAAG TGTCTTGAAG TATCGTGAAG 1860
TGCTAATGTA GAGCAGGCTG AGGACTCTGT TAGTGGAGGG TGGCGAATTG TGGCTACTGG 1920
AAATGTTAAT TACACCTTGG TGGTTAAAGA AGCACAGTGG TCCTAAAGAA TAGCTGCCCT 1980
CTTAACTAAA AACAGAAAGG CAATAGCTGA GGAGGAAATA AATCTTACCT TTATTAAGAT 2040
AGATTTTTCT GTGCAATATA AATCAATGTC TTTGTTGGTC TGTTGTTTAA TTCCGGACTA 2100
AGATGTCATA GCTGATTTAG TCTGATCCTT TCTCTCGGGC TGACGATGAA CGGGAATCGA 2160
TTGCATTTGT GCGATCAATT TTCTGCTTGT G 2191