EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11379 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:14010450-14012790 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:14012519-14012530TTTTATGGCCT-6.02
Foxa2MA0047.2chr4:14010666-14010678TGTTTACTCAGG+6.37
Foxq1MA0040.1chr4:14011214-14011225TATTGTTTATT+6.62
ZNF384MA1125.1chr4:14010818-14010830AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:14010819-14010831AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:14011742-14011754TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:14011743-14011755TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:14011744-14011756TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF740MA0753.2chr4:14011295-14011308GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr4:14011293-14011306GTGGGGGGGGGGG-6.92
Enhancer Sequence
TGGGGCTAAT AATTCTGATT TTAACTGTAT ATACCTTAAT TTACCTACTT GAAGGACTCA 60
TCGTAATTGT GTGAGATCAT TGATTGGAAT GTAAAACAAA TTGTGGGTGG TTGTGGACCA 120
AGCAAATATC TAAATTGTTT CCTGCTTGGC ATTTGGTGGT GGAACAGTGT GTTTGGGTTG 180
GATGGGGGTA GGGAAAGGTC TCATCTTCTG GGTTGATGTT TACTCAGGAA TACTGAAATA 240
ACAAACAATG ATTAAGAAGG GGACAAAATG GAGGACAACT ACACAACACA ACACCTCAAC 300
GTCTGTCTTG AATGCATTAC TGACTATGTG CATTTCAAAA TATTAGGTTT TTTTATTCCA 360
AACTTTGCAA AAAAAAAAAA ACTTCATATT TCTGAAAATA GCTGCTAATC TGCAGCATGT 420
GTTGGTTGAT CTTGATTTTC TGGTTTTGGA CGCAGAGCCC AAAGGCTTCT TGGAGTGAAG 480
GTTGTTTTCC CATCTCGGTA CGGAGGAAGT GAAGGGCGTC ACAGGGCTCC AGGTTGTCCT 540
GTGGAATGTC ACAGTCGTAT AAGAGAGCCA AGGGCAAAGC TGAGGCCAGC GAGTTGGGAA 600
AGGGGGAATG TAAATGTGGG GAATTAGAAC CTGAGATGTT GAACACCAAA CTTGGATCTT 660
CTAACAGCCC TTTTGTTTTT GTTTAGCTGT TTTGTTTTAG TTGTATTGCG TTCAAGTTCT 720
GTTGTTTGGT TTATTCTTGA TTAAAACATT TAGTTTTTTA TATATATTGT TTATTGTTTG 780
GTGTTTCTTG TGTTGTTGTT TTTTTGTTGT TGTAGTTGTT GTTTTGTTTT TGTTTTTTTG 840
TGTGTGGGGG GGGGGGGGTT AAGTTGTTTT TGTTTTGCTG GTTTTATGTT TTTTGATTTG 900
TTTTGTTTTT ATTGTTTGAA TTTGTTTGAT TCCATTTTTG TTTTGTTTTG ATATTCCATG 960
TTTTGTATTT TTGTTGGTTT TGTGTTTTGG ATTTTTGTTG TTTTTATTTA GCTGGTTTTA 1020
TGTTTTTGAA GTTGTTTTGT TTTATTGTTT GAATTTGTTT GATTCCATTT TTGTTTTGTT 1080
TTGATATTCC ATGTTTTGTA TTTTTGTTGG TTTTGTGTTT TGGATTTTTG TTTGGTTTTT 1140
GTTGTTTTTA TTTTGCTGGT TTTATGTTTT TGAAGTTGTT TTGTTTTATT GTTTGAATTT 1200
GTTTGGTTTA TTTTGTTTTG TTTTCATAAT CCATGTGTTG TGTTTTTGTT GATTTGTGTT 1260
TTTGTTTTTG TTTTTGTTTT TGTTTGGTTA AGTTTTTTTT TTTTTTGCTA GGTTTGTTTT 1320
TGTTGTTTTG TGTGTAATTG TTGTTTGGTT TATTTTTTTA TTATTTTTTG TTGTCCTTTG 1380
GTCTGTATTT TGTTGTTGTT GTTGTTGTTG TTTATTTGGT TTTGGAGTTC CTTGATTTGT 1440
TGTTTTTGTA TTTTTGTTGT TTTCAATTTT GTTGTTGTTG TTGTTAAGTT GATTTTTCTT 1500
TTGCTGGTAT TTTGTTTTTG GTGTTCAAAT TACTTTGGTT TAATTTTTGT TTTGAATTTT 1560
TGTTTTTCTA TTTGGTTTAG TTGTTTTTGT TTTGCTGGTT TTATGTTTTT GATTTGTTAT 1620
ATATTATTTA TACATATGGT TTATGGTTTT ACATGGTTTA ATTTTTATTT TTTGCTTAAC 1680
TCTTATATTC CATGTTTTGT GTTTTGTTGG TTTTGTGTTT TGGGTTGTTG TTTGGTTTAG 1740
TTGTTTTTGT TTTGCTGGTT TAGTTTTAAT TTTTTTAGTT TTCATAGTTT GAATTTAGTT 1800
TGGTTTTATT TGTTTTGTTT TCATATCCCA TGTTTTGTAT TTTTGTTGGT TTTATATTTT 1860
GTATTTATGT TTGGTTTAGT TTTTTTGTTT GTTTTGTTGG TTTTGTGTTT AGTTTTTTTG 1920
TTTTTGTTCG GTTTAGTTGT TTTTGTTTTG TTGGTTTTAT GTTTTTGATT TTAGCAATTT 1980
TTTAGTTTGA ATTAGTTTGG GTACATATTT TCCCCTGCAT TTTTAATCAA TATTTTGACT 2040
ATGCATTTAA ACAGTTGAGC AAACAAAAAT TTTATGGCCT TCAACTTAAG AGGTAATATT 2100
TAAACACCAC AAGTCATAGT AGTCGAATAT GCAAACTGCA GCGATTCACA TCTTTATAAT 2160
TTAAACATTC TATTCAAGGA GTAGAAAACA ACGTGACTAT GATCAAACCA CGCAAAGCAC 2220
ACCTCAATTA TATCAAGCTT CTGCAAGCAC TCAGAGCTAA AATGAAATGA AGGCTGTAAC 2280
CAAAATCCAA AGCAGATTTG GGGAGGATTG CACCCCTTTC CCCTGACAAA CAGCTTTTCT 2340