EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11346 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:10921053-10922407 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:10921780-10921791TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr4:10921459-10921472AAATTAATTAACA+6.19
Lhx3MA0135.1chr4:10921599-10921612AAATTAATTAACA+6.19
PBX1MA0070.1chr4:10921431-10921443TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr4:10921571-10921583TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr4:10921749-10921761TATGATTGATGG-6.37
Enhancer Sequence
AAATTACTTA CTATTATTAC TACCTATGCC TAATAGTGGG CAGGTATTCA ACACATATAT 60
TGATTCAAAA GAACTGTGTA ACCATTGATT GATTGACACA GATGTACATA TTACTGATGG 120
ATTGATGACT GAATATAATT GGAATTAATT TACACAAATG GACAAATTAT TTAACAGATA 180
GATGGACTGA AAGATGTATT GATTAATAGA CAACTGGACA AACTAAAATT CGATGGATGG 240
ATGGATACAG ATGAACATTT AACTGATGGA TTGATGAGTG GATAACTGAC AAATGTTGAC 300
AAATTTCTTT TTGGATGGAT GGATGGATGG ATGGACACAT TACTGATGGA TTGATGGGTA 360
GATATGATTG AACAAAATTA TGATTGATGG ATTTACACAA CTGAACAAAT TAATTAACAG 420
ATAGATGGTT TGTATGATGG ACGAATTGCT TTTCGGATGG ATGGATGGAT GGACACATAT 480
TACTGATAGA TTGATGGGCA GATATGATTG AACAAATTTA TGATTGATGG ATTTACACAA 540
CTGAACAAAT TAATTAACAG ATAGATGGTT TGTATGATGG ACGGATTGCT TTTTGGTTGG 600
ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAC GGACACATTA 660
CTTATGGATT GATCAGTAGA TATGATTGGA CAAATTTATG ATTGATGGAT TTACACAACT 720
GAACAAATTA ATTAAAATAT AGATGGACTG AAATATGGAT TAATTCTTAA TGAACATTGG 780
ATCAATATAT GGATGGATGG ATACAGATGG ACATTACAGA TGGATTGATG AGTGGATATG 840
ATTGGACAAA TGATAGACAG AGCTGGACAA ACTAAAATTG GATGGATGGA TGGATGAATG 900
GATACGAACC GACTAACAAA TAAATGCATT GAAGGATGGA TGATTTGATT AATTGACCGA 960
CACAACTAGT CAAACTAACA TTGGATGGAT GAATGGACAT ATTACTGATG AATTGAAGAG 1020
TGGATATAAT CAAACAAATT CATGATCGAT GTATTGACAA AAAAAGAAAA ATGAATTAAC 1080
AGATAGATAG ATTGAAGGAT GGATGGATTG ATTAATTGAT AGATACAACT GGACACACTA 1140
ACAATGGATG AATAGACATA AACTGACTAA TAGATAGATA GACAGACAGA CAAACAGACA 1200
GATTTAAAAC CAAAAATATC CTTTATCTGC GTGTGAATTG CCCAGTGGCG CTCAGTAACT 1260
AAGCTCTATA CACAGGAAAT GGTATTTCTA TGAATGAGTG TCCAGCAGAC GCCCACTCCA 1320
CACATCATGA GTCATTGACT GAGACTTGGT GTTC 1354