EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11314 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:8655791-8656736 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr4:8656194-8656210CTTTGTTTACTTTAGC-6.93
FOXC2MA0846.1chr4:8656195-8656207TTTGTTTACTTT-6.62
FOXD2MA0847.2chr4:8656196-8656209TTGTTTACTTTAG-6.59
FOXP2MA0593.1chr4:8656195-8656206TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr4:8656192-8656209CTCTTTGTTTACTTTAG-6.77
Tcf12MA0521.1chr4:8656679-8656690AACAGCTGCTG+6.32
ZNF24MA1124.1chr4:8656002-8656015AAATGAATGAAGG-6.18
Enhancer Sequence
TCCGGATGCC AAAGTCCAAA GTCATGCACT ATAGGTGAAT TAAATAAACT AAATTGGCCG 60
TAGTGTATGA GTGTGTGTGT GAATGAGTGT GTATGTATGT TTCCAAGTAC TGGGCTGCAG 120
CTGGAAGAGC ATCCGATGCG TAAAAAATAT GCTGGATAAG CTGGTGGTTC ATTTCGCTGT 180
GGCGACCCCT GATGAATATT TAAAATTATT TAAATGAATG AAGGAATTAT TTAAAGAAAA 240
AACTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTCAGCTGA GTAAAACAGT 300
GTAAAAATAC ATTAAGATGC ATCCCACTTC CACAGGCACA TTCTTGTCCC CTGTAAACCT 360
GCAACACTTT CTTGTTTTAC TGTAGCCCGT AGTAAAGATT TCTCTTTGTT TACTTTAGCC 420
TCTTTCCTCC AGTCCCGCGT CTCTTATCTT TCCACCTCCA GGGCTGCTAG TGTTGCGTCT 480
CAGTGCTCCG CCTCGACCCC GTCCCACAGA CGCCCCTGAC CCCGTCCCAT TGTGCTGCGC 540
TCCGCATGCG TGTCCTCAAA ACGCTCCAAT GAACCCGTCC ATCCATCACA CCTTGACCAC 600
TTTGACCAAA AAAAGAGAAA AGCAGAGGAG GAGATGCAGA ATAAAAGAAA GAAGCCGCGG 660
CTTTTTTTTT CCAGTTGGAC GCACATGTTG CTCACAAAGC CTTTATTGGG ACGAAATAGC 720
GGAACTGCAG CTTGACACGC GAGATAGTAT GAAAAAACAA CTGTGTGTGT TGTTTCTGGA 780
TTGCAGACAG GTATGCAGGA TGGGCCGGTG ATGACAGAGA CTTGAAAGGT GCTGGAACTC 840
CCCTTAATGT CTGTGTGCGA GCAGGTAAAA AAAAAAGGAG GAGGATTAAA CAGCTGCTGA 900
AGACCACCGT TAAGTGTTCT CACGTGAGGT GTTAAAGGGA GGAGC 945