EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11303 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:8338752-8340551 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:8339292-8339309GGGTTTGTTTATTGTTT-6.17
Foxj3MA0851.1chr4:8339690-8339707GGGTTTGTTTATTTGTG-6.51
IRF1MA0050.2chr4:8339954-8339975GTTTGGTTTTAGTTTTTGTTT+6.23
Enhancer Sequence
TCTTTCACCT TGTATTCACA TTTGCAGATG AATGAAAAGA TCTGACAGGT GATGGCGGCA 60
CAGTGGAGTT AATAAAGCCC AAGTGCTGCA GGCGAATCAC AGGTTTATGG TCCTTTTTAA 120
ACACGCAGAT ATAAAAGAGT CAAACGGGAG CCTTTTATGA CTCGCCGGCC TGCCGACGCT 180
GCTTTTATTG AGAGGGAACA TATTACAGTC CCTGGGGGGA GGCCTTTTTT CATCCTAAAT 240
GTCATTTTTG CAACCTGCCA TAACAGACTG GGTGCAGCAC AACATGTAGG ATCCATTAGG 300
AAGCTACAGT TGGCCAAATA TTAGCAAATG AAATTCTGTG AGATGGAGGA GCAAACCTAT 360
TTATTAGGTT GGGTTTGGAT TGCTTGGGTT GGGTTAGGTT TGTTTTGTTT TGTTCATGTC 420
ACTTGTGGTT GGTTTGGTTT GTTCCATCCA TTTTTTTGTG GGCTTGCTTT GGTCCAGCTG 480
GGATTAGTGT GCTTAGGTTT ATTAATCTGG TTTTGTTGTG TGTTTAGTTC GGTGTTGGTT 540
GGGTTTGTTT ATTGTTTTTT GGGGGGCCTT TTTGCCTTTA TTAAGTAGAT AGGACAGTAT 600
TTCTGACAGG AAACAGACAG GAGAGGGAGA GAGGGGGCAG GGGAAATGTC CTCGAGCCGG 660
GATTCGAACT CGGGACGCCC TGAAATGCTA TTGCACCATA TGTCAATGCA CTAACCACTA 720
GGGTTGTTTA TTGGGTTTGT CGGGTTGGTT TGGTAGTTAT TTTTTCTTTC GGTTTGATTT 780
CAATTGTTTT TTTGTTTTGT TTTTTGACTG GTATTTGTTT TGTTTGGATT TAGTTGTATT 840
TAGTTAAGCT TGTTTGGGTC AGCTGGGATG AGTTTGATTG GTTAGGTTTT CATTTGGTTT 900
TTGTTGTGTG CTTAGCTTGG ATTTGGTTTG CTTTGTTTGG GTTTGTTTAT TTGTGGCATT 960
GTGTTTGATT GGGTTGAATT TGTTTTTGTT GTTTTTTTCT TTGTTGCTGT TGCTACTTTT 1020
TTAGATTGGT TTAAGTTATT TTGGGTTATT TGACTGGATT TTGCTCTGTT TGGTTTTGGT 1080
TAAGGAATTT AAATTTAGGT TGGGTTCAGT TGGGATGCAT TTGTTCAATT GTTTTTTGTC 1140
GTGAGTTTGC TTTAGTTTTG GTTTGCTTTT ATTGAGTTTG CTGATTTGTT ATGTTTAGTT 1200
TAGTTTGGTT TTAGTTTTTG TTTCTTTGAC AGCTTTTGGT TGTGTTTTGT TTAGTTCTGC 1260
TTCGGTTGGT TGGGTTTGAT TCGATTTTAT TTTGATTGGA TTTAGGCAGG GTTGTTTTTG 1320
TTTTTAGAAC TCAAAAATCA CAGACCAGCT TTAATCAGAT AAAACCAATA TACCAAGCTG 1380
TTTTATTAAA GCAGGGAACT GTTAAATTTC CAGCTAATAG TTTGTGCTTG ACCTAACAAT 1440
GAGCTGTGCG TGTAGAAGAA CCATCTTGGG ATTAGATGTT ACATTACTGT CTTGGGCAAA 1500
TTAGCATTGG CAGCTCCAGG TTCAGGTTTT TTTTCTTCTT GAGGTCTCTG TGGAATGTTC 1560
TTGAATGTTC CAGTCTGTCT TCCAAAACCT CTGAAGACTG ACGAGAGATC AAGCTCTAGC 1620
GGTAACACTG AGCAGAGGTG AAACAAAATT GCGGTAAAAA TCTGCCCGAC AAGGTCGTCA 1680
TCACTAATGC GGTGGCGAGA GCCATTCTCA ACACTCAGAG GGAAACGGAA AGAGAGAGAG 1740
GTAAAACCAG GCCGAGATGG AGGAATGAAA ATAGCGCAGG AAGAAAAGCT AGAGGCACA 1799