EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11280 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:6587035-6588882 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr4:6587647-6587662CACTAAACAAACAAA+7.26
FOXK2MA1103.1chr4:6587994-6588005CTTGTTTACAT-6.62
Foxd3MA0041.1chr4:6588271-6588283AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:6588275-6588287AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:6588279-6588291AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:6588283-6588295AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:6588287-6588299AAACAAACAAAC-6.32
MyogMA0500.1chr4:6588751-6588762CTGCAGCTGTC-6.62
Tcf12MA0521.1chr4:6588751-6588762CTGCAGCTGTC-6.14
Enhancer Sequence
TGTGGACAGA GATTAGCTCC ATAGCTCCCT TCAGCGATGA AAGCACATGT AACTTATTTC 60
AGGTCTGACG GGGGAACATT ATTTTGGTCA TCAAACTGGA AATAGGCTGA AGCTAGAGTG 120
TGTGAAGAAG CAAGTGAAAA GCAGAGAAGG AAATACCATA CAGAAAAGAT GTGAATAAGC 180
CAGGGCTCGG TACTTTCTGT GAGGGTGATG ACACATTTCA AACCTCGCAG AGAGCACACG 240
CACAAAACAA AACTGTGTGG AAAGTGTGAA TGAATGATCT CATGCTCAAC AAAAGAGAAA 300
AGAACTAACA GCACTTCTGT TCACCTCAGC ACGATATTTA ATGAAAGCAG GAGGTGAAGA 360
AAGAACACAC GCAACTTCCA GAGGATGAGA AACAAAGCAG ACAGCCCTGA CTTTCACCTC 420
TCTAAACACT GACAGCATAA ACACACATAC ACACACACAC AGATGCATGC ACATACAAAC 480
ACACTCATAA ATACACAAAC ACACATATAC ACACAAACAC ACACACAAAC ACACACGCGC 540
GCACACACAC ACGTGCACAC ACAACAATAC ACACCACACA CAAAAATACA GACGCACACA 600
CAAACACACA CACACTAAAC AAACAAAACA CATGCAAGCA CATCCACAAA CACACACAGA 660
CGCACATCCA CAAACACACA CAGACACACA TGCACAAACA CACACAAATA AATGCACACG 720
CACACACAAA GACACTAACT TACATGCATG CACACACACA CACATACTGT ACACACACAC 780
AAACACACAC ACACACACAC ACACACAAAC TTACATGTAT ACACACACAC ACACACACAA 840
ATACACAAAC ACATAAAAAC ACACACAAAC ACACTTACAC TTATGCACAC CGACACACAC 900
ACCCACACAC ACACAAACAC ACACACACAC ACACACACTC ACACAAATAC ACAAACATAC 960
TTGTTTACAT GCGCACATAC ACACACACAC ACACACAAAT ACACAAACAC ACTTAATTAC 1020
ATATATGCAC ACACACACAC ACACAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1080
AATCACATGC ATGCACACAT TACACAAACA CACACAAACA TAAATAACAC ACAAAAACCC 1140
ACACAAACAC ACTTAATTAC ATATATGCAC GCGCGCACAC ACACACACAC ACACACGCAC 1200
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACAAAC AAACAAACAA ACAAACAAAC 1260
AAACACAATT ACGTATATGC AGACACATAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACAAAT 1320
ACACAAACAC GCTTAATTAC ATATATGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA 1380
ACAAACACAC AAACAAACAC ACACACACAC ACTCAATCAC ATGCATGCAC ACATAACACA 1440
AACACACACA AGCAAAAATA ACACACACAA ACACACAAAG TTACACATAC ACACAAAAAC 1500
ACACACACAC ACTGGGGACA CAAATGACAC CTGCCTCTCA CCAAAAGAGC ACAGAGGCCT 1560
TGATGAGTGA AAGCAGTGGG CTTGTTTGTG TTGCTGGTGG AGTTTTTCTG CGTGCTACAG 1620
TGTGTGTGCG GGAGGGGAAA GCTACATTTC CTTGCTCTGC TTTTCACAGA GATTGATTTT 1680
ACCTTGAGTG GCGTGCTAGA CAAACAGCAC CTCGGCCTGC AGCTGTCAGC TCATGAGAAT 1740
TACTGCCTTC AGCTCATGTG GACGTGCTGT ACTGGCTTAT GTATGTGTGT ATGTCTACTT 1800
CGAAACATGC CGAAGACAAG CCAAGGTGCT TTGCTGGTTT TAGCTGC 1847