EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11224 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:2486740-2488596 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr4:2488490-2488507CTGCATTAATTAAAACA+6.44
Gfi1bMA0483.1chr4:2488540-2488551GGCTGTGATTT-6.02
IRF1MA0050.2chr4:2487677-2487698ACAGAGAAACTGAAAGACAGA-6.24
LMX1BMA0703.2chr4:2488495-2488506TTAATTAAAAC-6.14
Enhancer Sequence
GCCTGGATAT ACATCGGAAA TCAAAAACTA AATACCAGAA TGGACAAAAA AACCCAATGA 60
GGGACTGCTG ACAGACAGCA GCACTGCAGA TACAGAGCTT CATCTGCTCA TCACACATTC 120
ACCTCACATG CTNGGAGAAG ATAGATAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 180
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGANNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 300
NNNNNNNAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGACT CACTGACAGA TCCAAAGAGA TGGAAAGACA 360
GACAGATGAA TGGACAGACA GGTGGAGAGG AAGAAGAACA GACAAACAGA CAGACAGACG 420
GATGGACAGA CGGACAGACA GACCAATAGA CAGAGGAAAA GACTAACAGA AAAATGGATG 480
GATGGGCGTA CAAACAGACA GAGAGACAGA CAGATGGAAA GACAGACAGA TGAACAGACA 540
GACAGATTGA GAAACAGATA GATGGACGGA GAGACAAACA GACAGACAAG GAAACAGACA 600
AGCCGATAGA AAGATGAAGA GACAAATGGA AAGACAGACA GATGTATGGA CAGACGGACA 660
GATTGAGAAA CAGACAGAAG GACGGAGGGA CAGACAGACA GACAGACCGA CAGACAAGGA 720
AACAGACAAA CAGATAGAAA GATGAAGAGA CAAGTGGAAA GACAGACAGA TGTATTGACA 780
GACGGACAGA TTGAGAAACA GACAGAAGGA CGGAGGGACA GACAGACAGA CAGACAAGGA 840
AACAGACAAA CCGATAGAAA GACGAAGAGA CAAATGGAAA GACAGACAGA TGTAAGGACA 900
GACGGAGAGA TTGAGAAACA GACAGAAGGA CGAAGGGACA GAGAAACTGA AAGACAGATA 960
GAAAGATGCA GGGACAGGTG GACAGACAGA TGAAGAGACA GACAGATGAA CAGACAGACT 1020
GATGTATGGA CGAACAGAGA GACGAATGGA TGGGAAGAAA GACAGACTGA TGGATAGACG 1080
ATGAGACAGA TGGAAAGATT GAGAGATAGA GAGACAGGCA GACGAACAGA TGGAGACAGA 1140
CAGAAAGACA GACCAACAGA TGGACAGATA AATGGAGAGA CAGACACCGA GAGAGACAGG 1200
CAGACAGACA GACTGATAGA TTGAGAGACA GGTGAATGGT TAGAAGGAGA CAGACAGACA 1260
GACAGACAGA TAGATATATA GATGGAGAGA CATACAGACA GACAGACAGA CAGACTGACA 1320
AAATTAATAG ACAGACAAAC AGATAGAGAG ACATACATAC AGGTGGATAG ATGAAGAGAC 1380
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAT GGGGATTGAT AGATTGGAAA AGACAAACAG 1440
ATGGAGAGAC ATAAAGACAG TTGGATAGAT GGATAGACAG ACGGAAAGAC AGACAGATGG 1500
GCAGACAGTC AGATAGATGA ACAGACAGAT GAACAGATGA ATAGACAGAC AGAAAAACTG 1560
GCAGACAGAC CTACTGACCA ATGAAGAGAT AAAGAGAAAG AGACAGACAG ACAGTCAGAA 1620
ATGCTGAAAC TAGTGCTTAA ACTAGTACTG CAAGACGGAG TCACTGCTGT CCGCTAAACA 1680
ACTCTAGTCA ACAATCTAAT ACTGTGAACA GAAATGCGCC CAGCACAGTG AGCAAGAGCT 1740
TGAACTAAGG CTGCATTAAT TAAAACACAA TCAGTCTCAG TGTGATTATC TAATCCCAAA 1800
GGCTGTGATT TACTATTAAG CAGATAATTA TATGAGTGAC ATTATATTCT CGCCTC 1856