EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11222 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:2422566-2425334 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:2423645-2423662ATAAAATAAACAAAATA+6.02
NFYAMA0060.3chr4:2424744-2424755TCTGATTGGTC-6.14
NFYBMA0502.1chr4:2424745-2424760CTGATTGGTCCAGAC-6.45
NR2C2MA0504.1chr4:2422647-2422662TGACCTTTGACCTAT-6.74
NR2C2MA0504.1chr4:2424040-2424055TGACCTTTGACCTAT-6.74
NR2F1MA0017.2chr4:2422643-2422656CACATGACCTTTG-6
NR2F1MA0017.2chr4:2423347-2423360CACATGACCTTTG-6
NR2F1MA0017.2chr4:2424036-2424049CACATGACCTTTG-6
Nr2f6MA0677.1chr4:2423351-2423365TGACCTTTGACTTA-6.15
Nr2f6MA0677.1chr4:2422647-2422661TGACCTTTGACCTA-7.64
Nr2f6MA0677.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.64
POU1F1MA0784.1chr4:2424727-2424741CTCATTAGAATATT-6.02
POU2F1MA0785.1chr4:2424792-2424804AATTTGCATAAA-6.11
POU4F1MA0790.1chr4:2424400-2424414ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr4:2424400-2424416ATAAATAATTAATAAT+6.2
POU5F1MA1115.1chr4:2424792-2424803AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr4:2424789-2424805TCCAATTTGCATAAAT-6.23
RXRBMA0855.1chr4:2422647-2422661TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRBMA0855.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRGMA0856.1chr4:2422647-2422661TGACCTTTGACCTA-7.25
RXRGMA0856.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr4:2422647-2422661TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
Enhancer Sequence
TATCTATCTA TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTATGTC TGTCTGTCTG TCTGTGTATC 60
TGTCTATCTA TCACACACAC ATGACCTTTG ACCTATAACC TGAACAACAA ATAAATGTCA 120
ATCATGTCGT TACACATATT ATTAATGTTT TATTTCCCAC CTATAAGAAA TAAATTGATG 180
CCATCTACCT GTAGATACGT AGATGAAGAG GCGCCCTCTA GTGTATCTAG GGTGATAATG 240
GTCTGTGTTC GAACTGGCTA AAATGTGCAA TGACGTTAGC CGCTTCAAAC ATTACAGGGG 300
GCGCTAAACT GCGGTTTTCT CTGTGTTAGT ATCTATGATG TTTAACAGAG TAAATGAATG 360
TTCACTGTAT GTCTGATAAT GTTTTTTTTT CTTCTGGATA AAGTCTTATT TGTTTTATTT 420
TGGCAGTAAT AAAAGCAGTT TTAAATAAAT GTTTTTTTTA AATAATTTTA AGGTCACTAA 480
TTATGTCCTA TAAGCAATAT ATATTTTTTC AATGGTCTCC AGAACAAACC ATCATTATAC 540
AATATCTTGA CTAATTACCC TGACCTGCCT AGTTAACCTA ATTAACCTGG TGAAGAATTT 600
ACATGTCACT TTAAGCTGTA TAGAAGTTTC TTGAAGTATA TCTATCTATC TATCTATCTA 660
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 720
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTC TGTCTCTCTG TCTATCACAC 780
ACACATGACC TTTGACTTAT AACCTAAACA ACAAATAATT GTCAATCGTG TCGTTACACA 840
TTTTATTCAT ATTTTATTTT CCACCTATAA GAAATAAATT GATGCCATCT TTTTAGTTAA 900
TGTCAGCATT AAGGTTTCAT TCAGTATTTG TCAGAATGTG GCTCTGATGT GACAGTCTGT 960
GAGTTAAAGG GTTTTCCTTT GCTAACTTGT CAGATGAGTT CCTCTAGTGA ACAAAAAAAG 1020
GAACTTTGAT GAAATTAAAG ATCAATAATA AAATCCAAGG ATAGATGTAC AAAACAATAA 1080
TAAAATAAAC AAAATAATTG TTTAATTAAT AAAATAAAAC TATTTAATTA ATAAAAATAC 1140
ATAAAATAGT TGCATATTGT TATTCAACAT TAGTAAAAGC ACTCTGCAAG TTGGGTCTGA 1200
ACGTTTCAAA GTTTGTCCAC AACAGGGCAG CACGTCTTTT GTTATATTGT GTAAAATAAA 1260
AAAAGATAAA GTCTTATTTG TTTTATTTTG GCAGTAATAA AATCAGTTTT AAATAAAATT 1320
AAAAAATAAT TTTAAGGTCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 1380
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT 1440
GTCTGTCTGT CTGTCTATCT ATCACACACA CACATGACCT TTGACCTATA ACCTAAACAA 1500
CAAATAAATG TCAATCATGT CGTTACACAT ATTATTAATG TTTTATTTCC CACCTATAAG 1560
AAATAAATTG ATGCCATCTA CCTGTAGATA CGTAGATGAA GAGGCGCCCT CTAGTGTATC 1620
TAGGGTGATA AATGTCTGTG TTCGAACTGG CTAAAATGTG CAATGACGTT AGCCGCTTCG 1680
AACAAACAGG GGGCGCTAAA CTGCGGTTTT CTCTGTGTTA GTATTTATGA TGTTTAACAG 1740
AGTAAATGAA TGTACAGAGT ATGTCTGATA ATGTTTTTTT CTTCTGGATA AAGTCTTATT 1800
TGTTTTATTT TGGCAGTAAT AAAAGCAGTT TTTAATAAAT AATTAATAAT TTTAAGGTCA 1860
CTAATTATCT CCTATAAGCA GTATATTTTT CAATGGTCTA CAGAACAAAC CATCGTTATA 1920
CAATAACTTA CCAAATTAAC AAAATAACAA ATTACCCTAA CCTGCCTAGT TAACCTAATT 1980
AACCCGGTGA ATAGTTTAAA TTGTCAGTCT TCTTTATTGA ATCATGTCAT TTAACAAGTT 2040
AGTGTTAGGT TAAGGGTTTG CTTGGGGTTA GGGTCAGGGT TTAGGGTTAG AATGAAGGTT 2100
TGAGCGTCTA TGCATATAGG TTAGTGTGTT AATACGAGTT TCACCCTCAT TATGTTTCAC 2160
CCTCATTAGA ATATTGGATC TGATTGGTCC AGACTCAAAG GGCTGTATCT TTTGAACAGT 2220
AGATCCAATT TGCATAAATG AGGTGTCATT TGATTCGTTA TTTATCCGTC TGTCCGTCTG 2280
TCTGTATATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 2340
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCCA CTATATATTA TCATTTTGAA 2400
TAATGTATAT TATTATTAAA ATATATTAGT TTCTTAAGAT TAAACTGATG TTTTCATGAA 2460
ATTCACTCAA AGTTTACATC AATAAAACAC AATAAAATAA ATCTGCACAA TGTGAGTTCT 2520
TCATGTCATT TCTGTGTGAC TTTAGGTAAC TATTTTTGGT GAAAGCGCCG GCGCTCAATC 2580
AGTCAGTTTA CATCTGATGA TCCAGAGCAG CAAACCTCTC TTTAAACAGG CGGTTTTCCA 2640
GAGTTTACCT TTCTCTATTC CTCTCAAAAC ACGGTAAACA CACACCAACA CTTATATAAA 2700
CCTGCGACCA GTGTCATGAT TACACTAACC AATGTTTCTG CTCAGACGCG AGTCTCTGAA 2760
GCTGGGAA 2768