EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11212 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:1515734-1517036 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr4:1516302-1516313GAGAGATAAGA+6.32
MEF2CMA0497.1chr4:1516836-1516851TATCCAAAAATAAAA-6.11
PBX2MA1113.1chr4:1516986-1516998ATGATTGACAGC-6.44
Enhancer Sequence
TCTGCTTTCT TGAACGAAAC AAAAAAGTAT TTAAAAGATG AAAATAATAG TATTTTTCAT 60
GCGTCAACAC CAAATAGACT TGGGCAGCTG TTAATATAAA GTCTATAGCT TTAAGGTCTG 120
TTAAAGTCTG TGAGGGAAGC ACTGATTTAC ACAAACTATT TATAATCAAT AATATTATAA 180
ATGCATTTAT AAAGACATAA CAAACCTTAG GCGGAAATAT ATACAGAAAC ACACAGACAT 240
ACACACACAC ACACACACAA TCATACCTGA ATTGGGCAAC CAGGTGAGAC ACAGGGTAAC 300
TAATCAGGGC AATTAGATTA CAGAAACAAT ATCGTTGCCT ATTCTTAATA GAAAAGTAGC 360
CAAGCAACAT CGCTCTGAAA AGTTGCCCAG TGTATCATCA CTATCGCTGA CATACACACT 420
GAAAGACAGA CACACTCACC TCTGGTCAGA AGTTGTCCTC TCTCTGGTTT TATCATTGTC 480
CGTCTGCTCT CCGTCGATTA CATTTGCAGC TGAAATCTTC GGCGGACACT GGAATTTGGG 540
TTTGGGAAGC ACTGAAGCAG GAAATAATGA GAGATAAGAT GCTTTTCACA TCCATCCATC 600
CATCCATCCA TCATCATCAT CCTGTCTATC TATCTGTCTG TCTGTCTGTC CGTCCGTCCG 660
TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 720
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 780
TCTATCTATC TATCTATCTA TCATCATCAT CCTGTCTATC TATCTCTGTC TGTCTATCCA 840
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCTATC CATCTATCAT 900
CCTGTCTATC TGTCCGTCCG TCCGTCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 960
TCCATCCATC CATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1020
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1080
TCTGTCCGTC TGTCTATCTA TCTATCCAAA AATAAAACAT TCTAATTGGA GTAAAGCATG 1140
AAGACATTGG TGTGATATTT CACCTTTAAA CATGCAGAAA CAACAAGATA TGACGGCAGT 1200
TAGAGAGTGT GTGGTGAAGC CCACAGTGAA AACCTCGTGT TAAACAACCA ACATGATTGA 1260
CAGCCACACT TCCTGTTCAC CACAGCTGCT GCTTCCCTCA CA 1302